甲沟炎的治疗方法需依据病情的轻重进行选择。轻度的甲沟炎即在指甲周围出现轻微红肿，按压后有轻微疼痛感，症状较轻的甲沟炎可自行治疗，可应用消毒剂，如碘酒等涂在指甲周围，起到消炎效果。还可口服抗生素，通常1-3天即可起到良好的治疗效果。若为严重甲沟炎，可能为真菌感染导致，口服抗生素无法起到良好的治疗效果，必要时也可以在局麻下行拔甲术，或者是甲床部分切除手术治疗。建议症状严重者及时到医院皮肤科就诊治疗。平时一定注意将指甲不要剪得过短，更不要用手拔“倒刺”，每天勤洗手脚，防止真菌滋生。
拔甲是治疗甲沟炎的常用方法。实际上，拔甲并不能很好地治甲沟炎。因为拔除的甲片再长出来后，如果继续把趾甲剪成圆弧形的话，甲片仍然会继续朝肉里长，可再出现的是嵌甲、疼痛、甲沟炎。如果不改变修甲和穿鞋的不良习惯，一般拔甲后3个月左右旧病又可能复发。
治疗甲沟炎，最快的方法就是吃消炎药，同时再外擦些杀菌止痒的药物，这样过几天就会好的。所以我们的家里应该有酒精或者碘氟，只要是哪里有伤口了，就擦上些，起到消毒的作用。
甲沟炎的治疗方法分为保守治疗与手术治疗。保守治疗主要是应用消毒药水消毒湿敷，常用的是用碘伏，或者直接用碘酒外涂指甲沟发炎的地方。手术治疗主要是给予手指或者脚趾神经阻滞麻醉之后，在发炎的指甲沟把局部的指甲拔出剪除，彻底深部清创伤口，然后定期用消毒药水换药包扎，能够达到深度消毒的作用。
平时穿宽松的，透气性好的鞋子，现在是需要局部酒精清擦，用盐水泡脚趾后，用干净的棉花塞在指甲和肉芽之间，开始不要多，一点点，每隔几个小时换一次，还有患甲沟炎的脚趾不要用随便洗，只能用盐水泡，大概用2个月多一点的时间。
早期甲沟炎可出现红肿热痛等症状，短时间内可化脓感染，出现甲下脓肿。甲沟炎和甲下脓肿是可以互相转化的，因此，做好早期甲沟炎的治疗十分重要，可采用热敷、理疗、外敷等措施，应用磺胺药或抗生素等消除炎症。