脊索瘤无法完全治愈，由于位置特殊，难以彻底切除，对放、化疗均不敏感，无特效药物。因此，各种治疗方法单独或者联合使用仅能控制疾病发展，无法彻底治愈。对于早期并且瘤体较小的患者，完全切除，四年左右可能复发，对于晚期并且瘤体较大的患者，切除很不彻底，术后很快会复发。
一般来说，脑部脊索瘤的症状是头疼、动眼神经、滑车神经等症状。具体分析如下：
脊索瘤是一种来源于胚胎时期残留或迷走的脊索组织的低度恶性的先天性肿瘤。脑脊索瘤主要是指发生在颅内的脊索瘤，大部分患者可能会出现头疼的症状。鞍区附近的脊索瘤可出现动眼神经、滑车神经等症状。患者可以通过伽马刀放射治疗、手术等方式进行治疗。
脊索瘤一般是无法治好的，首先脊索瘤是位于颅底的深处，在斜坡以及颅颈交界位置，位置是手术非常困难的，即使是通过手术切除，也无法完全的切除干净，因此手术后会出现复发。
脊索瘤不是癌症，它是一种良性肿瘤，没有癌症的恶性性质，脊索瘤生长比较缓慢，病程往往较长，头痛为最常见的临床症状，脊索瘤的临床表现会因为肿瘤部位和发展方向而有所不同，发生于颅底的脊索瘤，可以引起交通性的脑积水，如果向桥小脑发展，会引起听觉障碍、耳鸣眩晕等。
脊索瘤病人的平均寿命大约是6.3年。脊索瘤不进行任何治疗，平均生存率不超过2年。并且复发率相对较高。肿瘤能够完全切除，联合放射治疗，5年复发率可以达到百分之七十对于不能完全切除的复发率可以高达百分百。