小结石可以用刮匙或者钳子取出，个别的可用负压吸引取出。比较大的结石，可在表面麻醉下切开黏膜取出，但需要防止坠入呼吸道。如果结石刺激引起周围的炎症，可以口服消炎类药物局部治疗。对于顽固性的扁桃体结石，保守效果不好，可以行扁桃体切除术。
一般来说，去除口腔异味的方法有以下几种：
1、如果有糖尿病酮症酸中毒、肝脏疾病、肾病等引起的口腔异味，需要根据病因进行治疗。
2、如果有牙周疾病、咽喉疾病、鼻窦炎等疾病引起的口腔异味，需要专业医师进行检查和处理。
3、如果是因为幽门螺杆菌引起的口腔有臭味，需要彻底根除幽门螺杆菌。
患者要注意口腔清洁，每天至少刷两次牙。
扁桃体结石，如果其只是微小的食物残渣慢慢堆积而成，其可以在饭前饭后以漱口为主，都可以清出来。如果清不出，可以考虑用剜匙或者镊子将比较大的扁桃体结石去除。
扁桃体结石是不会癌变，是上皮过度角化的疾病。扁桃体结石是扁桃体的一个慢性疾病，同时可伴有其他咽喉部黏膜的结石。扁桃体结石，主要是由于扁桃体的急、慢性炎症，导致扁桃体隐窝处的上皮过度角化，局部所形成的一种尖锐的沙粒状物，附着在扁桃体表面。
扁桃体结石清洗的费用并不贵，一般在几十元到上百元之间。
扁桃体结石具体的清理费用，需要根据患者结石的多少来决定，如果只是单纯的一个扁桃体结石，医生可能直接在枪状面下，可以直接将其取出来，费用在50元左右。如果患者的扁桃体结石特别多，医生可能会用扁桃体隐窝冲洗的方法将其冲洗出来，费用在200元左右，具体的费用需要根据患者所到的医院或者地区来决定。
扁桃体结石一般清理价钱在几十元左右。
扁桃体并无结石存在，可能是慢性扁桃体炎引起的扁桃体隐窝口干酪样分泌物。扁桃体隐窝口的干酪样分泌物，呈乳白色或乳黄色颗粒样，气味臭，是由扁桃体隐窝内的大量脱落上皮细胞以及白细胞、淋巴细胞、细菌所组成。如无明显不适感，不需要特别进行清理，这些分泌物一般会自动排出、被咳出。如感觉到咽喉部有明显异物不适感，也可以到耳鼻咽喉科进行清理，费用无特殊的收费项目，各家医院相似收费，如咽部异物取出等。各省收费标准不同，如按咽部异物来收费，几十元左右。