如果卵巢囊肿选择微创手术，在三甲级别的医院做，一旦用腹腔镜，费用至少20000元以上，一般是20000-30000元之间。以下为常见一般公立医院收费参考：卵巢肿瘤是女性生殖器常见肿瘤，有各种不同的性质和形态，即一侧性或双侧性、囊性或实性、良性或恶性，其中以囊性多见，有一定的恶性比例。卵巢囊肿类型不同、治疗方法不同，手术难易程度和术后辅助治疗也存在不同。良性卵巢囊肿治疗费用约几千到一两万块钱不等；恶性或交界性肿瘤，手术范围较大，术后需辅助化疗等治疗方式，费用较高。
卵巢囊肿切除手术在5000元-10000元左右，主要根据选择的手术方式来决定。卵巢囊肿切除手术有开腹和腹腔镜手术两种，如果采用的是开腹手术，手术费在5000元左右，再加上术前检查和术后治疗，总的费用在7000元左右；如果是腹腔镜手术，因为是微创手术，采用的设备不同，对医生的要求也更高，费用相对会高一点，一般需要一万元左右，一般囊肿切除后，还需要进行一个病理检查，来确定囊肿的类型，是否存在恶性病变的可能，费用一般在300元左右。
腹腔镜下卵巢囊肿手术是一种微创手术，具有手术时间短、术后恢复快的特点。卵巢囊肿腹腔镜手术，费用大约需要一万多左右。由于医院的级别不同，手术收费的标准也不相同，相对来说，三级甲等医院的收费标准比二级甲等医院的收费标准高一些。此外，卵巢囊肿腹腔镜手术术后如果没有合并症的存在，就需要一万多左右，但如果出现其他的合并症或者是并发症，比如术中容易粘连，导致输卵管或者是膀胱的损伤或者其他脏器损伤，手术的费用会相应的增加大概2万左右。建议患者在手术前及时的了解情况，与医生做好沟通。
要进行常规的体格检查，抽血化验以及心电图、透胸透、血压的测量等。有特殊情况的还要做进一步的检查。确定身体可承受手术，充分做好术前准备灌肠、备皮。进入手术室，先进行输液、麻醉，开始手术、将卵巢囊肿剔除后要再次进行腹腔探查，无异常情况关腹，手术结束。手术后将卵巢囊肿，组织送去做病理检查。
通常情况下，卵巢囊肿手术可能会流血，也可能不会流血，具体情况分析如下：
一般情况下，良性卵巢囊肿切除后，是不会流血的，或者由于切除后伤口的原因会有少量的流血但不会很多。此外，手术后可能有内分泌的失调，卵巢功能的紊乱，导致雌激素孕激素调节轴紊乱，子宫内膜脱落，那么会产生少量流血，都属于一过性的，一般会自然恢复，可以暂时观察。如果阴道出血量比较多，超过月经量，就需要及时回医院接受相应的检查，找到真正的出血原因。
卵巢囊肿手术费用大概在5000元左右，具体的费用可以去当地医疗机构咨询一下，手术的费用可能包括术前术后的检查费用和消炎费用消毒费用。如果是发达地区的三甲医院，费用可能会更多。手术后应该做到饮食清淡、少吃油腻、辛辣的食物，以帮助伤口更快的愈合，同时也能够避免术后细菌入侵。