生殖器疱疹的原因很多，一般是由于单纯疱疹病毒引起的泌尿生殖器感染及肛周皮肤黏膜溃疡，有的是由于不洁性行为导致的，接触了病毒感染的内衣裤，导致间接感染，也可能是共用护用品导致。
不洁性生活：是感染生殖器疱疹的主要原因之一，发生在性生活活跃的男性人群中，特别是有过不洁性生活经历的青壮年，发生生殖器疱疹的概率非常高。感染单纯疱疹病毒。生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒引起的性传播疾病，主要表现为小水泡。生活中不管通过什么方式感染单纯疱疹病毒都可能引起生殖器疱疹日常生活中要多加注意，尽量少去公共娱乐场所，家里有生殖器疱疹病人用过的东西一定要分开放置，并严格消毒杀菌。
生殖器疱疹不治疗的话，有可能会出现反复发作，另外也有可能会因为性生活交叉感染。保证女性也出现生殖器疱疹的，目前就有一种治疗生殖器疱疹的新方法，不激光、不冷冻、不手术，而且费用也不高，几天就可以康复，并且没有痛苦，不会留下疤痕。
生殖器疱疹主要通过性接触传染，如果与生殖器疱疹有性接触很容易被传染，如同性恋通过肛交，口腔——生殖器性交等；其次通过间接接触传染，如通过生殖器疱疹使用过的衣服、被褥、便器、马桶和浴巾等均可能被分泌物污染而带上生殖器疱疹病毒还有血源性传染。
生殖器疱疹是一种传染非常强的性疾病，接触到病毒后3-5天，生殖器部位出现不适，起水泡。少数患者有高烧，头痛、全身不适，肌肉痛，水泡有单个或多个不等并溃疡，3-4天后开始干枯，结痂，此时没有规范治疗，病毒沿感觉神经再次进入神经，继续复制。如此时经过规范治疗，一般在一周左右治疗。