通常情况下，婴儿细菌性痢疾腹泻可以通过药物来治疗。具体情况分析如下：
婴儿细菌性痢疾腹泻的治疗，首先是应用抗菌素，细菌性痢疾是感染了痢疾杆菌造成的，此时就要应用头孢克肟等头孢菌素进行抗细菌治疗，等肠道的细菌被杀灭以后，孩子的腹泻症状自然就会好转。其次是给予对症支持治疗，如果腹泻的量比较多，要给予口服补液盐以纠正脱水和电解质的紊乱；发热超过腋下38.5度时，要给予布洛芬退热。
首先在治疗上需要抗感染治疗，如果腹泻较频繁者，还需要通过静脉输液来补充电解质，同时在饮食上要清淡易消化为主。一般在治疗后5到7日即可康复。忌肉类浓汁及动物内脏，忌粗纤维、胀气食物，忌性寒滑肠食物。
小儿痢疾和腹泻的区别在于包含范围上有所不同。
小儿痢疾一般是由细菌感染引起的，大便中会出现白细胞、脓细胞、红细胞等，大便时会出现内急后重的症状，同时还会有血样的粘液和脓血。腹泻有可能是由细菌感染、病毒感染、消化不良、积食引起，而腹泻的范围要比小儿痢疾更大。腹泻的症状是大便次数增多、便稀。会有粘液和脓血。这两种都是有区别的，通过大便常规的化验来判断。
如果孩子得了痢疾，首先要用抗生素，其次要注意孩子的身体状况，要注意孩子的情绪，避免出现中毒的一种脑疾病。腹泻是由细菌感染引起的，一般是由病毒感染引起的，主要是由于自身原因引起的，如果是消化不良，可以服用一些促进消化的药物。
判断孩子是腹泻还是痢疾需要从大便性状来看。
痢疾，大便多为水样，伴有呕吐，后期表现为不成型有粘液带有血丝。较重的臭味，体温会升高，精神萎靡、烦躁，甚至惊厥。排便前因腹痛尖声哭叫，排便时用力或面部涨红。普通腹泻时会大便次数多，并且大便量也多，也会伴有发烧呕吐，粪便呈黄绿色，带粘液且呈蛋花汤样，不会出现血便，并伴有轻微腹胀，肠鸣音亢进。
注意小孩腹泻时不能进食豆类，粗纤维较多，高脂类的食物。还有一些病症也会导致小孩腹泻注意观察。
痢疾性腹泻主要通过抗炎联合止泻的药物治疗。
药物会包括消炎止泻或者抗生素联合止泻的药物，止泻的药物能够治疗腹泻症状，并且可以缓解腹痛或者腹胀，联合消炎的药物能够缓解感染引起的肠道炎症。具体的用药要在医生的指导下，需要到医院进行肠镜检查和大便分析检查，根据患病的原因配合医生用药。
在服药期间饮食上要有所调整，要吃一些清淡易消化的流食或者半流食，避免吃油腻性的食物，会影响到药效的发挥与吸收。
