自身免疫性甲状腺疾病是免疫系统在保护甲状腺时会误伤甲状腺。
免疫系统应该会保护人体，但是如果把甲状腺自身的成分，比如甲状腺球蛋白、甲状腺微粒体、促甲状腺激素受体识别为敌人，发生防御反应，就会产生针对这些所谓抗原的自身抗体。自身抗体的出现越来越容易引起甲状腺自身免疫性疾病。此外，这些抗体的出现意味着出现了自身免疫性炎症，自身抗体如促甲状腺激素受体抗体，被称为弥漫性甲状腺肿合并甲亢，是一种非常常见的自身免疫性甲状腺疾病，表现为甲状腺合成分泌甲状腺激素增加、高代谢、甲状腺肿、甲状腺相关眼病。
通常情况下，自身免疫性甲状腺疾病相关肾病要做尿常规、血常规、甲状腺功能及相关抗体检查、肾功能检查、B超、组织病理学检查等。具体分析如下：
自身免疫性甲状腺疾病相关肾病包括Graves病、桥本甲状腺炎和原发性甲状腺功能减退症。血清中存在抗原和循环免疫复合物，故其伴发的肾脏病变又称为甲状腺抗原介导的免疫复合物肾炎，要做尿常规、血常规、甲状腺功能及相关抗体检查、肾功能检查、B超、组织病理学检查等。
自身免疫性脑炎如果比较轻微，一般不严重，但如果症状比较明显，可能是比较严重的。
自身免疫性脑炎是一类由自身免疫机制介导造成的疾病，患者可能会出现反应迟钝以及恶心、呕吐等症状，如果病情比较轻微，可能并不会特别严重，但还有一些患者可能出现癫痫持续状态，病情还伴有意识障碍，一般是比较严重的，建议要及时去医院，积极的用药物进行治疗。
自身免疫性甲状腺炎并不能彻底根治。
治疗的目的主要是要保证甲状腺功能的正常，一般有弥漫性甲状腺肿或者是轻微的甲状腺疼痛。在不明显的情况下，不需要特别的处理。建议定期进行碘营养补充。如果有压迫感，可以选择手术，配合中药，可以减小术后的复发风险。
建议患者在生活中主要饮食健康，避免食用辛辣、刺激性食物。
通常情况下，自身免疫性甲状腺病能治好。
毒性弥漫性甲亢与桥本甲状腺炎是自身免疫性甲状腺疾病的两种类型。这两种疾病都是可以控制的，但是很难治疗。弥漫性毒性甲状腺肿性甲亢，是由于体内有一种对甲状腺产生的抗体，这种抗体会导致内分泌突眼和高代谢症状，经过正规的治疗后，病情可能会复发，而且病程较长。桥本甲状腺炎的治疗比较简单，只要长期服用甲状腺激素就可以了。
本身免疫性甲状腺炎不能根治，但在临床上也不会有太大的影响，就拿桥本甲状腺炎来说，就是一种自身免疫性甲状腺疾病。
一般情况下，甲亢的情况一般不会很严重，因此抗甲状腺药的用量也比较少，大部分桥本甲状腺炎都有可能发展为桥本甲减，因此在治疗上要通过补充甲状腺激素来进行治疗，主要是为了将甲功恢复到正常，并没有太大的危险。