甲肝、乙肝感染后，因潜伏期而异，故发病时间不一。
甲型肝炎潜伏期约2周至6周不等，平均4周。乙肝潜伏期为1-6个月，平均3个月。这是因为乙肝病毒主要通过血液传播，因此一般不会引起明显的临床症状。甲肝做为一种急性传染病，感染后在潜伏期内迅速起病，发生肝功能不正常。因此，要及时对疾病做出诊断和治疗，如果延误了病情，可能会造成严重的后果。乙型肝炎可存在一个急性过程，亦可为慢性携带过程，因此，乙型肝炎在感染以后相当长的一段时间里不会发生，潜伏时间较长者达十余年之久，20年或一生不发病，仅显示肝炎病毒的携带情况，且肝功能正常。这说明乙肝病毒的存在与机体免疫系统功能失调有关。因此与乙肝的患病时间不一样，需结合病人实验室检查及临床症状加以鉴别。
甲肝、乙肝、丙肝主要是通过抽血检查的，是没有办法通过这些外表的症状去判断是否有这些疾病的存在，一定是通过抽血检查的。甲肝是通过抽血检查来检测甲肝抗体，乙肝是通过抽血检查乙肝两对半，丙肝的筛查是通过丙肝抗体来进行的。如果筛出了甲肝抗体，需要进一步检测甲肝抗体IgG和IgM。乙肝筛查发现后还要做乙肝DNA和肝功能检测，乙肝DNA含量越高，说明传染性越强。丙肝筛查出丙肝抗体为阳，需要进一步检测丙肝病毒RNA，如果检测结果为阳性，说明有传染性，需要进行治疗。
甲肝炎初期表现为疲乏无力，食欲减退，小便颜色加深，并伴有高烧，严重者可使巩膜变黄。
乙肝患者会出现乏力、容易疲劳、轻微发烧等症状。失眠、多梦、肝功能异常、胆汁分泌下降、食欲减退、恶心、厌油、眼睛、皮肤黄染等症状。慢性乙肝的临床表现为右上腹、右季肋部的不适、隐痛、压痛、叩痛等症状。临床表现为恶心，食欲减退，全身无力，尿黄眼黄。
丙肝的主要症状有：容易疲劳、食欲欠佳、腹胀、肝硬化等。肝硬化如果出现黄疸、腹腔积液、血管静脉曲张破裂出血、肝性脑病等，都会导致肝硬化患者出现失代偿期。
甲肝和乙肝都是传染性较强的疾病，其严重程度无法直接比较。
甲肝和乙肝有其自身的不同之处，甲肝属于急性肝炎，通过消化道传播，大部分肝功能受损不严重，患者需要多休息，同时服用保肝降酶的药物。乙肝有两种，一种是急性乙肝，一种是慢性乙肝，90%以上的急性乙肝可以自行治愈，而慢性乙肝则需要长期治疗，有些人甚至终身服用药物，同时还要定期监测肝功能、乙肝DNA、肝脏彩超等相关指标。由于具体病情不同，并不能简单地说甲肝或乙肝哪个更严重，平时都需要引起重视，避免被传染。
肝脏受损的程度与肝脏受损的程度有关，肝脏损伤越重，情况越严重。
大部分情况下，甲型肝炎都是比较轻微的，好发于儿童和青少年，通过保肝降酶的药物可以在短时间之内痊愈，不会发展成长期。慢性乙肝是一种常见的疾病，如果是慢性乙肝，就必须进行长时间的抗菌药物，有些病人会有肝功能受损严重，有严重的肝损伤，有严重的肝衰竭的危险，这种病人的死亡率很高。
乙型肝炎，需要2-3周左右的时间才可以排除。
甲型肝炎的窗口期一般为2-3个星期，即从感染了甲型肝炎病毒到可以检出甲型肝炎抗体igm。乙型肝炎的窗口期为6星期，如果感染了乙肝，人体可以检出乙肝表面抗体，在此期间可以进行检查。乙肝是由消化道的粪便传染，乙肝是由血液、母婴传染的。患者平时要定复查，并且还需要在医生的指导下进行治疗。