一般情况下，异位心律心房颤动需通过转复窦性心律、控制心室率、抗栓治疗3个方面来进行。具体分析如下：
1.转复窦性心律：假如房颤发生在48小时之内，需给予药物或者电转复，转复为窦性心律。长期的持续的房颤可进行射频消融治疗，使房颤转为窦性心律。
2.控制心室率：长期持续性的房颤心房较大，即使转为窦性心律而不能维持的患者，以控制心室率为主，在静息状态下控制在80次/分以下，活动的状态为100次/分以下。
3.抗栓治疗：假如房颤超过48小时，心脏内容易形成血栓，血栓脱落易堵塞脑血管形成脑栓塞。要给利伐沙班和华法林等抗凝药物治疗，其中，华法林须监测凝血指标INR。
异位心率说明心脏起搏的位置不在窦房结，说明存在有传导功能的异常，所以需要做动态心电图检查看一下，如果有问题再进一步指定治疗措施。如果没有问题，可以暂时观察。
持续性房颤的治疗涉及到其病因的治疗。与甲状腺功能亢进一样，甲状腺功能亢进可引起持续性房颤，因此治疗甲状腺功能亢进有助于持续性房颤的治疗。控制心室率，重建窦性心率，预防栓塞。由于地高辛能增加房室传导的延迟和阻滞，故通常可通过地高辛控制心室率。例如，独自地高辛不够有效。维拉帕米(维必定)最有效。
心房颤动治疗强调长期综合管理，即在治疗原发疾病和诱发因素的基础上，积极预防血栓栓塞、转复并维持窦性心律及控制心室率，医生会根据病因、临床症状不同等给予药物、手术或者射频消融治疗等不同的治疗方案。
对于已不适合药物转复或药物及电复律转复失败的老年患者，治疗目的则是控制心室率。目前常用药物有洋地黄、β受体阻断药、钙通道阻断药、胺碘酮等。中医药对房颤的主要干预手段有药物治疗、针灸疗法等，例如参附注射液，温补心阳，安神定悸。用于心阳不振所造成的心慌不安、胸闷气短。
有的心房颤动能根治，如孤立性房颤、阵发性心房颤动等，对此种情况可先考虑转复，转成窦性心律后，若日后不再发作，则算根治。
如转复失败，亦可行射频消融术（RFA）.射频消融术成功率可达甚至更高，获得成功后亦等于痊愈，但对持续性心房颤动（房颤），和永久性心房颤动（房颤），则难以根治，通常仅采用控制心室率和抗凝等方法。