直肠多发息肉的治疗需要根据息肉的大小来定，如果息肉＜1厘米的，一般可以考虑直肠内镜下给予EMR治疗，也就是圈套器切除。如果息肉＞1厘米，＜3厘米的，可以考虑在内镜下切除给予ESD切除也就是给予DUAL刀或者是IT刀局部切除。
结肠多发息肉可以采取以下办法进行治疗。
结肠多发息肉分为家族性的遗传性结肠多发息肉，其恶性程度高，一般会选择手术摘除部分肠道。多发息肉，两个或两个都是多发性，而家庭型的，则不是两个、三个、四个、五个、几十个、上百个。如果不是遗传多发性结肠炎，可以通过结肠镜手术切除，消除大部分由息肉引起的恶性变化，也有可能发展成大肠癌。
宫颈息肉以手术切除为主，药物只是辅助治疗。可行息肉摘除术或电切术。用血管钳夹住息肉蒂部，向一个方向旋转，予以拧除。小息肉用血管钳即可钳除，稍加压迫止血，或在颈口处塞以纱布一块，24小时取出。息肉较大，蒂较粗者，摘除后基底断端可用烧灼止血。如为多发性，可稍扩张颈管后搔刮，同时作诊断性刮宫。
宫颈息肉是慢性宫颈炎的一种表现，是子宫颈管腺体和间质的局限性增生，并向子宫颈外口突出形成息肉，通常为单个也可以为多个，红色、质软，宫颈息肉可以行息肉摘除术，在月经干净3到7天进行术后将切除的息肉送病理检查。
结肠息肉多于一枚就称为结肠多发息肉，可定期观察，一年查结肠镜一次。如果息肉介于0.5到2.0两厘米之间，则可以在结肠镜下行高频电凝切术，如果息肉大于2.0厘米，癌变几率增高，原则上需要开腹行结肠部分切除术，但如果为带蒂的息肉，多属于良性病变，也可在结肠镜下行高频电凝切术。
结肠息肉多于一枚就称为结肠多发息肉，可定期观察，一年查结肠镜一次。如果息肉介于0.5到2.0两厘米之间，则可以在结肠镜下行高频电凝切术，如果息肉大于2.0厘米，癌变几率增高，原则上需要开腹行结肠部分切除术，但如果为带蒂的息肉，多属于良性病变，也可在结肠镜下行高频电凝切术。