可以吃一些具有清热解毒，利尿通淋作用的中药，对输尿管结石的治疗也是有一定帮助。输尿管结石单纯的使用中药治疗效果就不理想，这时候大部分病人需要进行手术治疗。
输尿管结石依据结石大小、部位及有无合并症治疗方式不一，结石＜0.6cm，没有合并症，可通过多喝水、多运动等排石治疗将结石排出，或是服用排石药物。结石较大，合并梗阻、感染，可行微创手术。微创手术损伤较小，出血较少，优于开放式手术。
如果输尿管结石小于0.6个厘米，这个时候可以选择保守的疗法，比如说多喝水、多运动、配合一些药物的治疗，当这结石它的大小比较大的时候，或者说结石的形态不光滑，要选择另外的方法了，比如说体外碎石，或者微创手术的方法。
输尿管结石通常都是由肾结石，掉落下来而形成的。输尿管结石的临床症状是腰痛，肉眼血尿，典型的体征是肾区叩击痛。若输尿管结石小于六毫米，可以通过排石药物来进行治疗促进排石。若输尿管结石大于六毫米，小于1.5厘米，可以通过体外冲击波碎石。若是输尿管结石大于1.5厘米，可以选择手术来进行治疗，常用的手术方式是经尿道输尿管镜钬激光碎石术。
中医治疗肾结石和输尿管结石效果不好，肾结石的形成是由于尿中晶体物质浓度升高，析出结晶并在局部生长、聚集的结果，结石活动会出现疼痛和血尿，中医中药有促进结石排出作用，常用于辅助治疗。