脊髓空洞症的治疗方法为手术治疗，这是因为目前没有确切的药物手段使脊髓空洞减小或消失，也难以使病者的症状得到持久和有效的控制，目前主流的手术治疗方法为脊髓空洞分流术和颅后窝减压术。一般对于有明确小脑扁桃体下疝和相应脊髓空洞表现的病者，都采取后颅窝减压术。
中医治疗难以控制脊髓空洞症的发展。脊髓空洞症一旦已形成，很难通过药物治疗缓解。应该及时到神经外科接受手术治疗，以免延误治疗时机，引起严重的神经功能障碍。
脊髓空洞症术后主要观察生命体征、体温变化、切口观察、术后原有症状和感觉变化和皮肤护理、术后的康复。
一些有颈椎缺损的病人，其颈部和颈部的连接部位不稳，需要进行颈椎的融合，这类病人需要在护士的引导下进行颈部的制动，尽可能的降低颈部的运动，并维持轴向的翻转，即颈部、肩部和臀部的门轴转动，有助于身体恢复。
脊髓空洞症最好的疗法是手术，其原因是至今尚无精确的药物手段可以让脊髓空洞缩小或者消失，同时很难让病人的病症获得持久有效地控制，而现在主流的术式是脊髓空洞分流术、颅后窝减压术等。
通常对具有明确小脑扁桃体下疝及相应脊髓空洞（症）征象者均采用后颅窝减压术。如小脑扁桃体下疝等原因未明，或者虽有小脑扁桃体下疝存在而与其脊髓空洞轻重不符，则可考虑行脊髓空洞分流术；若为存在寰枕部前方畸形并形成受压时还可考虑前路减压术治疗。
脊髓空洞症只要积极治疗，采取一定的措施是可以治疗的，但目前并没有什么特效疗法是可以真正的痊愈。脊髓空洞症是一种缓慢进展的，脊髓变性疾病，病变位置多见于颈部骨髓，主要发作于20到30岁的青年，偶尔发生于儿童时期，起病比较隐匿。
一般情况下，脊髓空洞的原因有多种，最主要的原因是由先天性缺陷导致的，也就是所谓的小脑扁桃体下疝。因为小脑扁桃下疝气会阻碍脑脊液的正常流通，导致脊椎孔隙形成。
此外，慢性脊髓蛛网膜炎、脊髓内肿瘤如室管膜瘤、星形细胞瘤等、椎间盘突出、黄韧带钙化、脊髓梗死、脊髓外伤等病因，也可以通过对这些实质性损害或压迫脊髓，影响脑脊液循环的机制，引起脊髓空洞症。