多指畸形可以在几个星期或几个月内得到康复。
一、药物疗法
目前尚无有效的药物。
二、手术治疗
1.手术原则：手术治疗多指畸形不但要达到美观，而且要恢复手的功能。多指的外科切除并不是很难，但是要综合考虑多生手指的外形、位置、结构、与正常手指的关系，综合X线片综合考虑，确定多指的切除位置和方法。单纯多指多指手术和局部皮肤整形；复杂多指除多指外，尚须全部或部分切除。手掌的手术需要根据患者的手部形态和功能恢复情况来决定。除多指外，还需进行关节、骨骼畸形矫正、韧带修补、皮肤整形等。
2.手术时机：只需用细长的皮蒂连接到正常的手指，只需简单地摘除，在出生后就可以进行；对于单纯多指，尤其是尺侧多指，3~6月时最好行外科手术；对于有严重畸形和组织缺损的多指，可以采用显微外科技术，在1周岁后施行多指切除、组织移植、移位等手术，并定期复查，直到其发育终止。1岁以上的手掌和指骨截骨矫正；3岁以上儿童为佳，掌长肌腱移位较好。
3.手术方案：由于手指的解剖结构差异很大，所以其治疗往往要比想象中的复杂，单纯的切除往往会带来畸形，关节不稳定，甚至出现功能障碍，所以需要视具体情况而定。原则上，保留功能良好、外观正常的拇指。当多指有重要的神经血管束时，要注意将其分开，避免损伤，并保留；如果存在主要的肌腱或内部肌的止点，则必须将其移至相应的保持大拇指的位置。在手术中，为了保持大拇指关节囊和关节囊的稳定性，需要在手术中保存多指关节囊和韧带。如果保留的大拇指过度倾斜，则需要在骨骺发育基本停止后进行关节融合或截骨术。
4.手术注意事项：多指切除手术要注意彻底切除，以免留下的畸形会影响美观，因为多指手术一般都是在学前手术的时候，要注意不能损伤到骨骺，以免影响生长。
婴儿多指畸形主要跟遗传因素有关，具体如下：
父母家庭成员中有多指畸形病人，子女多指畸形的概率就会增加。孕期母亲受到电离辐射，如X线、CT检查等，可能损伤胚胎。孕期母亲用了致畸药物也会导致多指畸形。母亲生活习惯不好，如吸烟、喝酒容易导致多指畸形概率增加。腹部创伤导致胎盘受损也会使多指畸形发生的概率增加。
如果宝宝出现多指畸形，建议家长尽快带宝宝去正规医院的骨科、整形科或者是手外科就诊。
多指畸形主要是通过手术摘除，最好在6个月之后进行。6个月之前，儿童对麻药的抗性较弱，可能会增加外科手术的危险性。此外，小儿神经、血管及肌腱发育较弱，在手术中难以辨识，主要是要避免指神经、血管及肌腱出现损伤。因此，最好是在六个月之后进行手术。
小儿患有多指畸形要尽早到综合医院骨科、整形外科、专业的手术外科就诊。
让专科医师判断多指畸形类型和严重程度，确定治疗的最佳时机和手术方式。患儿多指畸形，手术时机一般在半岁后。小儿半岁前对麻醉的耐受能力较差，且手指过于纤细，神经血管肌腱解剖没有半岁后清晰。手术方式以切除为主，复杂的多指要采取两个手指合并的方式，恢复手指大小和功能。
多指切除术可以进行截骨。多指切除术一般有以下几种：
1、对于没有直接骨连接的多指，可以在其连接的关节、皮瓣等部位，将其余的皮瓣进行修剪。
2、对于有骨性连接的多指，必须在其连接的根部完全裸露，并进行合适的截骨，然后进行适当的打磨和涂抹骨蜡，以避免再次出血，然后一层一层的进行缝合。
3、存在并指时，由于手指间存在骨桥，应充分暴露于此，再进行截骨。在切除多余的手指时，要尽量保持合适的皮瓣，避免皮瓣不够。
先天性并指多指畸形的治疗方法有如下几种：
一、手术
如果患者无法站立或行走异常，则可以通过手术来进行治疗。
1、表皮：采用“Z”形的方法，将剩余的手指（趾）组织起来，用来覆盖分开的并指，当骨头并连的时候，将其连接起来，并连在一起，一边被肌腱下的皮的时候，再进行侧副韧带的修复。
2、平衡肌力：严重并指多指，由于有内部肌指头的异常，所以要进行肌腱止点再造。
3、调整骨力线：指骨力线不正常时应进行截骨，某些重度多指并指畸形中有三节拇、纵向括弧骨等结构，应进行截骨，以纠正力线。
二、其他治疗
手术后疤痕疙瘩应及早介入治疗，疤痕疙瘩是由于术后皮肤受损，导致的胶原蛋白过多而导致的一种真、原形态，呈现肿块状浸润，在医学上称为“良性真皮瘤”。
1、瘢痕注入：采用5-氟尿嘧啶及类固醇等在瘢痕部位进行局部注射。结，应用低浓度的甲基喋呤配合叶酸能明显地阻止疤痕组织的增殖，如果有明显的疤痕增殖迹象，应尽早进行治疗。
2、光电治疗：主要是激光和其它治疗方法，强脉冲激光和595nm脉冲色素激光具有吸收血红蛋能降低疤痕的供血和去红的效果，适合于肥胖的增生性疤痕或者疤痕疙瘩。
3、光纤治疗：将纤维引入疤痕的内侧，可通过光热法的直接效应，达到促进疤痕愈合的目的。
4、压力治疗：压力治疗应该在手术后尽早进行，给予手指上的压力可以减轻脚跟外侧旋转。