卵巢囊肿分为生理性和病理性两种，生理性的卵巢囊肿是在女性排卵期滤泡聚集而形成的，往往几个月后会自动消失。病理性的卵巢囊肿在早期也没有明显的症状，有症状者多表现为腹部疼痛、月经不调、白带异常、腹部肿块等，容易被忽视或误诊。
卵巢囊肿就是指卵巢内有囊性的肿物形成，可分为肿瘤性和非肿瘤性两类，而通常生理性卵巢囊肿是指非肿瘤性的那一类。生理性卵巢囊肿是最常见的卵巢囊肿，一般发生在排卵期的育龄妇女，生理性卵巢囊肿一般会自动消失。
卵巢囊肿分病理性的和生理性的，生理性的可随生理周期的变化可以自然消失。由于疾病生成的病理性的囊肿，需要手术来明确诊断并作相应的处理。如B超提示囊肿为无回声的囊肿，没有分隔，那么可以先观察3个月，3个月后重复检查，如囊肿仍然存在，应考虑手术处理。
是根据超声检查来分辨是生理性的卵巢囊肿还是病理性卵巢囊肿。生理性的卵巢囊肿在例假结束后会自然破裂消失，因此在例假结束后3~7天到医院复查一个子宫附件B超或彩超检查，如果囊肿消失则为生理性囊肿，如果囊肿仍然存在那么为病理性囊肿。
一般情况下，生理性卵巢囊肿可以采用以下方式来去除：
患有生理性卵巢囊肿，没有出现明显的不适症状，可以暂时不治疗，进行临床观察。生理性囊肿一般会自己消失。患有生理性卵巢囊肿，如果囊肿很大，有腹胀、腹部疼痛等症状，可以进行穿刺。生理性卵巢囊肿如果在短期内增加的幅度很大，可以进行手术来切除。患者可以根据自身的实际情况，选择适合自己的治疗方式。
卵巢囊肿分生理性和病理性，生理性囊肿会随着月经周期而发生不同的变化，无需治疗3-6个月会自行消退或缩小，如果是病理性囊肿则要对症治疗，一般如果囊肿小于6cm需要先观察，定期到医院复查，大于6cm就需要住院手术治疗了。