脑炎患者如果经过积极治疗，短期内不会出现脑萎缩，但是如果不及时治疗，病程较长，很容易损伤脑细胞，长期处于脑萎缩状态。脑炎引起的脑萎缩可以通过中药或者物理疗法来治疗。治疗脑萎缩的原则是早发现早治疗，容易取得较好的疗效，同时要根据病因辨证辨病，营养脑细胞，促进脑组织发育。脑萎缩要及时治疗，避免出现语言障碍，智力低下，行为异常等不良反应。
对于脑萎缩的治疗方法是很难找出的，属于人的正常组织出现的一种不可逆的反应，主要还是采取营养脑细胞药物及改善微循环的药物控制，提供合理的营养，采用中药来治疗，通过针对性用药能短时间内修复病者受损脑细胞，疏通脑血管恢复脑部病灶供血供氧，促进脑细胞新生。
治疗脑萎缩，病人可以采取物理加中医的治疗方法，它是在中医的理论下结合现代化治疗仪器，共同作用的治疗方法，进一步促进病人恢复，饮食上应注意，应禁食辛、辣、腌、熏类是食物。平时应适当多吃些新鲜、含优质蛋白的食品、如乳类，肉类，蛋，鱼虾，蔬菜，水果，大豆及豆类制品等。
脑萎缩是指由各种原因导致脑组织本身发生器质性病变而产生萎缩的一种现象，有一定的遗传倾向，但大部分是由于疾病引起，比如脑外伤、脑卒中、脑炎、脑膜炎、脑血管畸形、脑部肿瘤、癫痫长期发作、烟酒过度、营养不良、甲状腺功能病变等。
采用神经细胞移植疗法来治疗，通过针对性激活受损“休眠”脑组织细胞，促进脑细胞新生，达到逐步恢复的效果。脑萎缩重点表现为头晕头痛、表情呆滞、记忆力减退、思维散懒、智力障碍、活动减少、寡言少动、对周围事物反应迟钝、失语、失认，幻听、幻视及性格改变。小脑萎缩重点表现为头晕、自主活动缓慢、站立不稳、步幅宽大、步态蹒跚、不能直线行走。