口腔溃疡在综合性医院应就诊于口腔科，在口腔专科医院应就诊于口腔黏膜科。口腔黏膜科除了可以诊治口腔溃疡外，还可以诊治扁平苔藓、白斑、红斑、黏膜下纤维化、盘状红斑狼疮等疾病。
临床所见口腔溃疡大多为复发性口腔溃疡，因为局部疼痛，影响饮食、语言等会给生活带来很大的困扰，所以有口腔溃疡后应该及时治疗，减轻症状。其治疗原则是消除致病诱因，增进机体健康，减轻局部症状，促进溃疡愈合，但是目前还没有特效药物，所以治疗时应针对每个病例的致病诱因和对药物的反应，有侧重地采用治疗方法和药物。
有口腔溃疡，应该先于医院就诊，检查口腔内是否有致使口腔黏膜破溃的残冠、残根、不良修复体等局部刺激因素，并且去除，进行系统治疗，如果不去除局部刺激因素，会导致反复的口腔溃疡，长期刺激甚至会导致口腔癌的发生。然后，口腔溃疡局部可以使用口腔炎喷雾剂或者西瓜霜外用，并且多吃水果、蔬菜及高蛋白的食物，补充人体所需的营养，增强抵抗力。
治疗费用大概要2百-3百元左右。主要是采用治疗方法不同，费用存在的差异，因为个人的口腔溃疡的病情严重程度是不一样的，因此需要的治疗周期就会有不同，费用也就不一样。
反复发生的口腔溃疡一般是复发性口疮。研究表明复发性口腔溃疡与精神因素、机体的免疫系统、与病毒感染、消化系统疾病、工作压力大、持续性精神紧张等有很大关系。复发性口疮自身有自愈性，病程10天左右，口疮会自愈，但一但出现口腔溃疡还是要积极对症治疗，局部保持清洁，涂生长因子、溃疡膏、应用糖皮质激素、提高机体免疫力、减轻工作压力、适当休息、补充维生素等。