小孩子咳嗽和扁桃体肿大是两个疾病，如果咳嗽久治好不了，需要排除鼻窦炎引起的鼻涕倒流到咽喉部，引起的反射性咳嗽可能。而扁桃体单纯性的肥大，是没有关系的。小孩子的咳嗽如果已经排除了下呼吸道的感染，可以到耳鼻咽喉科，遵医嘱进行治疗。
通常情况下，小儿咳嗽扁桃体肿大吃牛黄解毒丸、蒲地蓝消炎口服液等。具体分析如下：
如果小儿咳嗽扁桃体肿大，建议家长带患者去医院检查，明确病因，然后对症进行治疗。如果是因为上火引起的，可以吃黄连上清片，或者牛黄解毒丸等，缓解症状。如果是病毒感染导致的，可以适当的服用具有清热解毒、消肿散结功效的药物，例如蒲地蓝消炎口服液、小儿抗病毒口服液等，帮助改善症状。
扁桃体肿大就是提示有内热，可以口服清热解毒的药物治疗。然后咳嗽可以给予止咳药缓解。要是有发热的，有高热的，就要进行退热的处理。宝宝的扁桃体肿大引起咳嗽。常见的就是急性扁桃体炎，有些会引起发热，但是咳多数是干咳为主。如果宝宝咳嗽有痰的，那就必须要考虑宝宝是不是合并有支气管炎。
天生扁桃体肿大容易诱发出扁桃体自身的免疫反应，而导致扁桃体反复的发炎。
出现了扁桃体的肿大，出生时即可出现睡眠打鼾及憋气的情况。可能会影响到婴儿的吞咽、饮食及生长发育，其阻塞呼吸道，而且伴随晚上睡眠时的严重缺氧，都会影响孩子的生长发育。孩子在青春期之前接触到病毒细菌的感染，就很容易诱发扁桃体的反复发炎或者化脓，严重的还会伴发有心肌炎、肾炎等并发症。
建议及时到正规医院耳鼻喉可就诊，做好相关检查后进行对症治疗，以免延误最佳治疗时机，影响孩子的身心发育。
一般情况下，小孩扁桃体肿大，可以通过药物治疗、手术治疗等方法进行治疗。具体分析如下：
1.药物治疗：小孩扁桃体肿大，多见于急性扁桃体炎，伴有发热、轻咳、咽痛等症状，家长可以在医生的指导下使用复方金银花颗粒、阿莫西林胶囊、罗红霉素片等药物给宝宝治疗。
2.手术治疗：小孩扁桃体持续性肿大，即使予以抗感染等对症治疗，依然无效，可以考虑手术切除扁桃体。
家长要让小孩多休息，注意保暖，空气注意流通；平时要让宝宝多喝水，预防脱水，同时加强营养摄入。
扁桃体肿大会导致身体慢性和急性炎症。
扁桃体肿大会引起炎症。慢性炎症的症状主要表现为小窝黏膜上皮增厚，表面角化过度;急性炎症症状主要表现为扁桃体实质内充血，有多形核白细胞浸润，在黏膜表面可见黄色斑点，小窝口可见脓性物排出。严重者可引起耳鼻喉全身症状，影响儿童身心健康。
建议到正规耳鼻喉科医院检查，根据个人情况对症治疗，期间注意饮食清淡，不要吃辛辣刺激的食物。