右附件囊肿可以使用以下方式处理，具体分析如下：
生理性黄体囊肿是正常情况下不会有什么表现，也不需要进行治疗。右附件巧克力囊肿是由子宫内膜异位引起的，一般会出现进行性加重的痛经，也有继发不孕的可能，如果囊肿大超过5厘米，需要进行腹腔镜手术。如果是正常的囊肿，不超过三公分，一般不会有什么特别的表现，可以口服桂枝茯苓丸。
治疗上，通常有保守治疗和手术治疗两种。小于五厘米的囊肿，可以采用保守治疗的方法。并且要定期复查，随时关注囊肿的症状。如果药物治疗效果不理想，有继续增大的趋势或者囊肿大于五厘米，一般需要手术治疗。
如果囊肿的尺寸比较小，而且性质是单纯性囊性的，可以考虑，无需特殊治疗。可以考虑在月经干净后3到5天之内复查一个B超，多数情况下有可能自行消退。如果囊肿的尺寸相对比较大，但是在尺寸50毫米以下，可以通过药物进行消炎，如果超过尺寸50毫米，需要通过手术处理。
右附件囊肿有生理性的和病理性的两种，前者主要见于黄体囊肿和滤泡囊肿，黄体囊肿是在月经期后半期出现，而滤泡囊肿则多是在月经期的前半期出现，待月经干净后多会自然消失，不会对身体造成不良影响；病理性卵巢囊肿是因卵巢的上皮细胞异常增生而形成，需要在医师的指导下决定是否需要药物或手术治疗，或只需要定期复查就可以。
附件区的囊肿可能是生理性的，1-3个月经周期之内，囊肿通常就会自行的消失，所以不需要用药，可以使用彩超定期观察即可。如果附件区的囊肿持续存在的时间超过三个月，患者首先检查肿瘤标志物，如果肿瘤标志物没有因此，可以使用桂枝茯苓丸、散结镇痛胶囊等中药来治疗，如果中药治疗效果不好，患者需要则选择手术治疗来治疗。
一般情况下，附件囊肿为生长于输卵管或卵巢部位之囊肿，亦为临床较常见之妇科疾病，其严重程度应视附件区囊肿之特定特性而定。
如果附件囊肿在三公分范围内，没有特殊并发症，囊肿不大，通常不会导致并发症，可选择保守治疗。如果附件囊肿较大，超过三公分，则会产生很多明显症状，如不孕不育、盆腔包块等，甚至还能引发异位妊娠。如已达或超过3厘米，需及时手术。