输尿管结石手术费用在30000-50000元之间，手术费用从最简单的不需要麻醉的体外碎石的一两千块钱，到微创手术，输尿管硬镜的两万多块钱不等，经皮肾镜以及输尿管软镜，总的算需要30000-50000元左右。
治疗方式主要有输精管镜下钬激光碎石取石术，这种手术方式对于一些输尿管中下段的结石，效果会比较好，手术住院的花费一般在15000元。输尿管软镜下激光碎石术，这种手术方式对于输尿管上段靠近肾盂开口处的结石效果较好，费用一般在20000元左右。腹腔镜下输尿管切开取石术，这种手术对于较大并且质地坚硬的输尿管结石效果较好，费用一般在20000元之内。
可以吃一些具有清热解毒，利尿通淋作用的中药，对输尿管结石的治疗也是有一定帮助。输尿管结石单纯的使用中药治疗效果就不理想，这时候大部分病人需要进行手术治疗。
输尿管结石依据结石大小、部位及有无合并症治疗方式不一，结石＜0.6cm，没有合并症，可通过多喝水、多运动等排石治疗将结石排出，或是服用排石药物。结石较大，合并梗阻、感染，可行微创手术。微创手术损伤较小，出血较少，优于开放式手术。
如果输尿管结石小于0.6个厘米，这个时候可以选择保守的疗法，比如说多喝水、多运动、配合一些药物的治疗，当这结石它的大小比较大的时候，或者说结石的形态不光滑，要选择另外的方法了，比如说体外碎石，或者微创手术的方法。