腱鞘囊肿治疗方法有手术与非手术治疗两种，在这些腱鞘囊肿中，有一小部分病人可自行消退，但是有些病人在经过各种治疗后仍复发，非手术治疗和保守治疗的复发率比较高，但是这类方法的创伤最小，容易为病人所接受，临床可作首选治疗。
可经挤压致使腱鞘囊肿断裂而渐渐自行吸收，但在治疗之后，可反复发作，连接关节腔不易断裂，可通过穿刺将囊液拔出，再加压按压或拔出囊液，送入肾上腺皮质激素进行局部加压包扎，一般均能起到治疗作用。
手术治疗是指在其他治疗无效的情况下，腱鞘囊肿可手术摘除，但仍存在不同程度的复发机会，故术后需避免病部关节不断重复连续运动和剧烈运动，为了避免再复发的可能性。
腱鞘囊肿的病人，手腕部位很大，一般有以下几种原因：
第一个原因，就是囊肿本身。有的病人在出现腱鞘囊肿后，会很快就会有大量的液体聚集。这种情况下，病人的整个手腕都会出现明显的肿胀，特别是背部。尤其是那些消瘦的病人。
第二，也有可能是腱鞘囊肿引起的无菌性炎症。在腱鞘囊肿的发生过程中，会导致周围的软组织发生无菌感染。这时候，会有大量的液体堆积在这里的软组织间隙，导致手腕很肿。
手腕腱鞘囊肿可以通过手术治疗。治疗方法具体有：
1、若为早期腱鞘囊肿，并伴有腱鞘囊肿，可用手指按压，等待其吸收。
2、如果腱鞘囊肿比较大，同时伴有粘连，应以外科手术切除为主。腱鞘囊肿是一种很难治疗的疾病，必须要彻底的切除，这样才能避免复发。通常，在早期，主要是采用挤压等保守疗法。随着时间的推移，当腱鞘囊肿越来越大，并且越来越顽固时，必须进行外科手术。
手腕腱鞘囊肿的患者可以及时前往正规医院，在医生指导下进行详细的检查。
腕部的腱鞘囊肿通常可以根据病人的临床表现和身体情况做出明确的判断，需要做一些局部的超声波。一般是不需要特别的治疗，只要是主动的观察就可以了，但是一旦发现有压迫的迹象，或者是血管和神经被压迫，就必须进行外科治疗，术后还要注意日常护理，防止感染。
手腕部位腱鞘囊肿经挤压可破裂并能减轻。
腱鞘囊肿有许多是由关节产生的，可采用按摩、揉捏、试着能否使其进入关节腔的方法。还可设法将腱鞘囊肿顶入骨内，强行挤压可将囊肿击碎。但由于囊壁尚存在，此种治疗复发机会较多。建议到医院做手术彻底切除，效果会更好。
建议患者在日常不要自行挤破腱鞘囊肿，避免引发不适症状。
手腕部腱鞘囊肿需要通过日常护理、使用药物等方式来处理。
手腕部腱鞘囊肿的患者需要避免用力过猛，导致肌腱囊肿扩大。另外，在肌腱囊肿发病后，没有任何活动，也没有影响到腕部的屈伸和承重。假如腕部的屈伸和承重受到了一定的限制，那么就可以进行囊肿的穿刺，取出囊中的液体，然后在囊中注入一些糖皮质激素，或是使用无水乙醇进行治疗。如果在经过以上的处理之后，肌腱鞘囊肿复发，则要进行外科手术，将其完全切除。