不一定的，如果孕妇在怀孕的时候有急性或者慢性疾病，可能会对胚胎造成不良影响。或者在过程中又接触到一些有毒有害的物质，体内存在叶酸缺乏等，就可能会导致流产、胎儿畸形等问题。
通常情况下，意外怀孕的小孩健康。具体情况分析如下：
意外怀孕一般是指一对夫妻都没有生育计划，没有定期的备孕，也没有提前吃过叶酸，但是却怀孕了。意外怀孕的孩子大多身体健康，因此在意外怀孕后，只要有生育需求，就可以继续怀孕，在产检时要做全面的检查。妊娠中后期要注意避免胚胎出现畸形的情况。
就算是正常的备孕，胎儿也不一定是完全健康的，有可能会发生胚儿停止发育。
在没有准备的情况下怀孕了，只要没有阴道出血及腹痛，做彩超显示胎儿宫内发育正常，这个孩子是可以要的。注意休息口服叶酸，防止胎儿神经管畸形。多吃水果和蔬菜。
如果意外怀孕前没吃叶酸，孕后要连续吃3个月，可以很好地预防胎儿畸形，不妨买一些孕妇专用的叶酸片，孕前没有补充孕后也不可大量服用，吃多了会阻碍身体对锌元素的吸收。
意外怀孕的话，只要是在最近一段时间没有服用过一些特殊的药物，或者说没有一些不良的饮食生活习惯的话，基本上不会对孩子产生什么影响，怀孕期间一定要定期的去医院进行检查，防止胎儿发育出现畸形。