针对病因，采用手术治疗和药物治疗，多数无需治疗。包括压迫眼球、按摩颈动脉窦、捏鼻用力呼气和屏气等反射性兴奋迷走神经的方法。电复律、电除颤、心脏起搏器植入和消融术等电学治疗方法等。
临床上要根据窦性心律不齐的原因及严重程度来决定病人如何治疗。对于轻度窦性心律不齐的病人，平时没有任何临床症状，也不合并任何器质性疾病，可以暂时不给予治疗。而对于显著窦性心动过缓伴有心脏停搏的病人，建议要积极的给予提。高心室率的药物改善病人的临床症状，必要时安装永久性心脏起搏器，以降低心源性猝死的发生。
儿童心律不齐需要进行相关治疗，包括病因治疗、药物治疗及手术治疗。病因治疗如甲亢或者心脏损伤，严重的心肌炎或者先心病手术时出现并发症。有些患儿在电解质紊乱乏氧的情况下也会出现心律不齐，要针对病因给予相应处理，心律不齐会消失或者减轻。
孕晚期心律不齐需要注意休息以及保持心情舒畅。
一般在孕期女性出现心率不齐，可能是由于体内胎儿的逐步发育变大的时间过快，从而压迫到体内其他的器官，迫使心脏的负担加重所引起。那么就需要孕妇避免劳累，多休息，保持心情的舒畅，避免焦虑紧张。如果胸闷的症状比较严重，那么建议到医院进行心电图检查，以排除心脏出现病变的可能。
对于孩子心律不齐，父母可采取如下办法治疗：
1、一，生理性窦性心律不齐，作心电图常发现为窦性心律不齐，如精神状态较好，吃饭一般，无需特别处理，由于不少患儿出现窦性心律不齐；
2、二是病理性心肌炎引起，对患儿应给予心肌炎治疗，使用糖皮质激素或抗病毒中成药治疗，如蒲地蓝消炎口服液等、蓝芩口服液等；
3、还要增加儿童心肌的营养，例如，果糖二磷酸的施用，大补维生素C，因而对心肌炎消退有利，等到心肌炎得到控制后，患儿心律不齐亦有明显好转。
如果病人的心电图显示窦性心律不齐，不需要进行任何干预治疗，必要时可以做动态心电图的检查。窦性心律不齐常见于年轻的患者，有时在做心电图的时候深吸气，也会诱发窦性心律不齐，并不是病理状态，只是一种生理异常，不需要进行任何的口服药物治疗，也不会影响到病人的身体健康。病人如果出现窦性心律不齐，并没有其它特殊的症状，可以暂时不用吃药治疗，病人可以保守治疗，如果病人出现心慌胸闷等情况，要去医院做个心电图的检查，排除一下心脏器质性的疾病引起的这种病变，如果是单纯的，就是心律不齐，没有出现什么症状，可以暂时不用治疗，只是省着定期的随访观察就行。