大便次数增多，会出现腹痛，其次有嗳气、早饱、恶心、泛酸。进食硬、冷、辛辣等食物或受凉、气温下降时，可引发或加重症状。部分患儿会出现食欲不振、乏力、消瘦及头晕，伴有胃糜烂者可出现黑便。
慢性肠炎，其症状主要表现为反复的发热，腹痛，腹泻等情况。慢性肠炎的治疗，以口服药物治疗为主，包括收敛止泻的药物，调节肠道菌群失调，肠功能紊乱的药物以及抗炎的药物等，慢性肠炎患者要注意定期复查肠镜等相关的辅助检查。
幼儿得了慢性肠炎会有便秘，腹泻或者是两者交集的情况，腹疼，大便稀薄，不同的孩子还会有些不同的症状，孩子出现症状，要注意尽早给孩子检查和治疗，用肠道益生菌来改善情况，注意母乳喂养的，母亲不要吃辛辣刺激的和生冷的。
儿童慢性结肠炎最常见的临床症状是黏液便及脓血便，轻者每天3～4次，重者数十次，呈血水样。轻度病人无腹痛或仅有腹部不适。一般有轻度至中度腹痛，系左下腹或下腹阵痛，涉及全腹痛，排便后缓解的规律。还可能有贫血、发热、腹胀、消瘦、乏力、肠鸣、失眠、多梦、怕冷等症状。
慢性肠炎主要症状无特异性，多数有不同程度的消化不良症状，主要有反复性的腹部胀痛，疼痛部位不确切，通常发生在饭后，大便稀薄并带有黏液，有的甚至带有少量脓血，排便次数增多，每日2次到3次或更多。
儿童结肠炎一般表现为腹痛，腹胀，腹泻、便秘，粘液便或脓血便。可以口服益生菌进行对症治疗。平时多喝温开水，多吃新鲜的蔬菜和水果，饮食宜清淡易消化，不宜吃生冷及辛辣刺激的食物，每天要适当的运动，促进肠蠕动，保持大便通畅，同时注意腹部保暖，避免受凉。