对于性功能障碍的治疗，首先要找出性功能障碍的类型和诱发因素。只有找到了具体的原因，才可能成为治疗的目标。由每个人不同的身体状况引起的性功能障碍的因素也是不同的，这取决于是精神疾病还是疾病。这一点必须清楚地理解。如果找不到药物，盲目使用是不好的。
性功能障碍主要表现为性交障碍、性欲障碍、射精障碍、性高潮障碍等。
性功能障碍是与神经系统、心脑血管、内分泌、生殖系统等相关的复杂生理过程。该病常会出现性交障碍、性欲障碍、射精障碍、性高潮障碍等。建议及时到医院检查治疗，可以选择药物治疗、性教育、心理治疗、行为治疗等，避免对生活和身体造成伤害，平时要注意饮食卫生，饮食清淡，不要过度劳累，要有充足的营养。
在临床上，引起性功能障碍的原因有：
第一点，就是生理上的问题，当人类变老时，性机能就会慢慢衰退。
第二，是心理上的原因，此外，也存在着一定的心理和心理问题，比如说患者在做爱的过程中会很紧张，也会因为之前的性爱失败而产生不正常的行为。还有一些性机能失调，这也许是因为宗教的文化观念造成的。
第三，也有可能是由于肥胖症引起的，患有糖尿病的患者，可能会引起性功能障碍。
性功能障碍危害会影响夫妻之间的性和谐，甚至引起家庭婚姻不幸；导致心情压抑，会失去男人的尊严，丧失男性的阳刚之美，还有可能导致不育不健康的精子和卵子所孕育出来的生命质量是不能保证的，性功能障碍时身体机能下降的结果，积极的到医院进行检查治疗。
男性出现性功能障碍可以通过口服药物、物理疗法、手术等方法进行治疗，也可以采取中西结合方法综合性治疗，男性在性生活当中不能正常勃起或者勃起硬度差，平时注意减少手淫，加强运动。
性功能障碍有性欲低下、阴茎勃起功能障碍、、阴茎勃起时间很短等临床表现，具体分析如下：
1、性欲低下，对性生活无兴趣，此时应检查体内的激素水平，尤其是雄激素水平。
2、阴茎勃起功能障碍，有性生活的想法，但不能硬或硬度不够，西地那非是治疗的首选药物。
3、阴茎也足够坚硬，但持续时间不长，由于阴茎头敏感，所以射精时间短，可以选择达泊西汀，也可以在阴茎头涂抹局部麻药。