可以通过药物、手术等方式治疗甲亢突眼症。
对于突眼的药物治疗，可以选择强的松等皮质激素，但作用缓慢，病程长，副作用也多。还有一些其它的免疫抑制剂，比如环磷酰氨，也可以起到一定的效果，不过副作用会比较大。除此之外，云克治疗也可以用来改善突眼的症状，但是效果并不是很好。对严重的突眼症可以通过外科手术来进行治疗，但其效果并不明确。对于突眼症较严重的患者，可以采取其它的治疗措施，以减轻眼窝内的压迫，并配合换血疗法。
只要积极的用药治疗，甲亢控制后突眼的症状都会慢慢改善。
皮质类固醇是临床治疗眼球突出症最常用的药物，具有一定的治疗效果。使用方便，但见效慢，病程长，副作用多。其他免疫抑制剂也有一定的作用，但副作用很大。其他方法，如严重眼球突出的放射治疗、血液交换治疗，甚至手术治疗，都不是很确定。中医辨证治疗甲亢，副作用小，疗效值得肯定。
出现甲亢突眼的原因主要有：一、单纯性眼球突出
甲亢患者自身免疫功能紊乱，机体对甲状腺产生抗体，从而引起交感神经兴奋，上睑提肌收缩得比较强烈，容易出现上睑挛缩、眼球略突出、眨眼减少等症状。这种单纯性突眼会随着甲亢治疗的改善而消失。
二、浸润性眼球突出症
这种眼突是自身免疫反应引起的，T淋巴细胞识别眼球外肌的自身抗原，从而产生多种炎性因子，导致眼周外组织水肿，眼眶后组织容量增生，浸润性突眼。对于这种眼突现象，需要在医生指导下使用肾上腺皮质激素、免疫抑制剂等药物进行治疗。
三、其他理由
眼突除了与甲亢有关，还可能与眶内肿瘤、炎性假瘤等占位性病变有关。
甲状腺相关眼病，不是所有人都要做甲状腺相关的眼病，主要有两种：一是眼眶减压，就是眼眶体积增大，眼睛扩大了，眼球就会向后缩，这样就能解决突出的问题。第二种方法，就是做眼睑收缩，使患者看到的凸起其实并没有凸起，只是眼球向后收缩。第三种情况，就是做手术的时候，会有两个影子，导致眼球外肌失去平衡，需要做手术。
甲亢是指甲状腺功能亢进症，甲状腺功能亢进症引起的突眼可能会恢复。
因为在甲状腺功能亢进症期间，交感神经的兴奋引起的，导致眼睛瞬间睁开，眼睛向上抬时额纹不能皱起，造成突眼。在治疗了甲状腺功能亢进症后，突眼就会逐渐消失。如果是恶性突眼，是因为眶后有炎症组织堆积引起，通常会出现眼肌变粗，恶性突眼如果能得到很好的治疗，那么其症状消失。