膀胱结石的最佳治疗方法大体上两类，一类为手术取石，一类为非手术碎石，其中手术取石即传统的耻骨上膀胱切开取石术，另一类的非手术碎石则又可分为膀胱镜机械碎石大力钳碎石、液电效应碎石、超声碎石、弹道气压碎石等。
膀胱结石外科治疗的方法包括内腔镜手术、开放性手术和体外碎石术。内腔镜的治疗：经尿道膀胱镜结石的治疗方法是目前治疗膀胱结石主要的方法。方法的优点，它可以直观、直接的碎石；可以同时处理下尿路的梗阻性疾病，比如说尿道狭窄、前列腺增生。目前使用较多的是钬激光碎石术：一个是可以治疗结石；第二个可以治疗引起结石的其他的疾病，如尿道的狭窄、前列腺增生等情况。
膀胱结石手术后要以清淡、低蛋白、低脂肪食物为主，要限制超量营养。应适当多吃粗粮和素食，饮食要多样化，多吃富含营养和维生素的食物，应该多饮水，不喝浓茶、浓咖啡，不憋尿，定时排尿。限制草酸盐摄入。草酸盐会与体内的钙结合形成草酸钙，沉积形成结石。
可以通过彩超检查判断膀胱结石的大小。如果膀胱结石比较小，有机会经过尿道排泄，可以辅助药物比如排石颗粒，另外就是多喝水，如果膀胱结石较大，可以考虑膀胱镜取石处理。
膀胱结石自古以来就是在膀胱里生成的，就在膀胱里长，土生土长的。继发性结石是从别的地方来的，比如从肾脏输尿管排到膀胱，或者从尿道里被塞到膀胱去，这种结石叫做继发性的膀胱结石。原发性膀胱结石前列腺增生的时候，膀胱里出现残余尿，沉淀之后或者伴发感染之后就会形成结石。