可以吃一些具有清热解毒，利尿通淋作用的中药，对输尿管结石的治疗也是有一定帮助。输尿管结石单纯的使用中药治疗效果就不理想，这时候大部分病人需要进行手术治疗。
输尿管结石因为嵌顿位置不同，导致的疼痛部位也不同，如果在输尿管上段，可能是腰部疼痛，如果在输尿管下段，一般是靠近下腹，但是当排尿的过程中，如果膀胱结石进入尿道，造成尿道堵塞，会引起阴茎疼痛明显。
结石是可以自己排出体外的，一般是可以从阴道插管，输尿管的病人一定要去正规的医院做插管手术，术后主要是防止输尿管粘连，其次防止血管堵住，输尿管一定要保持尿液通畅，在术后以抗炎治疗为主，保持个人的卫生清洁。
输尿管结石手术的治疗费用与结石的大小、治疗方法以及就诊医院级别、医院设备等有关。例如体外冲击波碎石在三甲医院一次是1000元左右，输尿管镜下碎石有钬激光碎石、超声碎石，碎石方法不一样，的收费标准也不一样，因此并不能确定具体的手术费用。
输尿管镜取石术发生并发症，穿破输尿管或者造成狭窄。结石直径超过1厘米或者是表面粗糙呈多角形正。结石嵌顿过久输尿管发生严重的梗阻及上尿路感染。需要开放手术取石。