进行康复治疗，首先要针对神经系统功能障碍进行积极的康复。主要是进行坐位平衡，站位平衡的训练，包括对瘫痪肢体的，被动和主动锻炼。当然是在康复医生的指导下进行系统训练。如果出现饮水呛咳，需要进行吞咽功能的康复训练，吞咽功能的训练，可能时间也会很长，同时可以配合针灸等方法进行治疗。
早期发现是可以康复的，及时发现病情，并且去做检查和治疗，康复的几率很大。晚期脑血栓发现疾病时间太晚，康复的几率就会很小。大脑已经受到了严重的损伤，康复是有困难的。
脑血栓后遗症主要通过药物治疗和康复功能锻治疗来进行。药物治疗主要是使用具有活血化瘀、芳香开窍疗效的中西药防止血栓复发。康复功能治疗则是配合按摩理疗等辅助手段，逐渐改善血循环状况。脑血栓康复治疗是一个长期的过程，必须持续用药和锻炼。
脑梗死是一种常见的神经系统疾病，又称缺血性脑卒中。中医是指中风或中风。它是一种由于各种原因引起的局部脑组织区域供血障碍，导致脑组织缺氧病灶坏死，导致临床上相应的神经功能缺损。坏死的脑组织对预后影响很大。总死亡率约为10%，致残率可达50%以上。脑梗死急性及恢复期易发生各种并发症，包括吸入性肺炎、痔疮、尿路感染、下肢深静脉血栓形成、肺栓塞、吞咽困难引起的营养不良等，均可显著增加预后不良的风险。
脑血栓后遗症的康复治疗其实不算是很贵，但是以长期治疗为主，一般康复治疗，大概两年，而且两年之后建议每年定期进行康复理疗，促进血液循环。治疗的单次费用一般是几十块钱到几百块钱左右，而每次治疗1~2个疗程左右就可以。
患脑血栓时，很容易引起偏瘫或言语障碍、头痛、头晕等症状，应注意休息，避免过度劳累。如果是卧床不起的病人，要经常翻身，经常做按摩。
一般家属可以给予按摩，减轻水肿或改善血液循环。一般按摩可以从四肢开始。按摩要轻柔缓慢，力度要合适。它不应该太硬或太轻。也可以做功能性肢体训练，或者理疗、针灸、艾灸等。治疗效果更好，也可以口服一些药物。注意患者的饮食。尽量低盐低油低脂饮食。