治疗性功能障碍的办法有中医疗法、物理疗法、食疗法等，其中物理疗法有一种是电子通络治疗法。运用尖端性功能障碍综合康复仪，集现代计算机技术、自动控制技术、电脉冲技术、数字显示技术、磁场辐射技术为一体，具备电脉冲激、负压吸引、气动按摩等多项物理治疗方式，通过专用器具施治于人体阴茎及有关穴位，调节大脑皮质功能，兴奋脊髓性中枢活动，扩张阴茎动静脉血管，激活海绵体动力、增粗阴茎海绵体的体积等整体治疗效果。
手术后性功能障碍可以通过药物来进行治疗。性功能障碍是指不能进行正常的性行为，或在正常的性行为中不能获得满足。性功能障碍多数都没有器质性病变，也就是说性器官没有异常或病变，而是因为心理因素造成的。因而在性学中常常称为性心理功能障碍。性功能障碍一般分为心理性性功能障碍和器质性性功能障碍，器质性性功能障碍主要是指阳痿、早泄、不射精等。
主要是由于性功能减退，从而导致的雄性激素分泌减少，而且激素减少以后就会导致阴茎不能勃起，或者是阴茎短小，可以补充雄性激素，而且也可以通过其他方式来进行缓解，比如手淫等方法。
戒毒半年后出现性功能障碍可能是性功能早退和肾虚。有手淫的不良习惯应戒除手淫恶习.同房前做好前戏，一次要求不要过高，这需要个磨合期的，一定要配合好。放松心情，不要紧张。戒烟酒,少食辛辣刺激食物,多喝水,不可过劳久坐,性生活要节制，不可禁欲和纵欲。
性功能方面存在问题，首先男性要从自身查找原因，如果是长期生活作息时间不规律、熬夜、抽烟喝酒，或者是纵欲性、生活紊乱，这些原因是会影响男性性功能的，要及时进行调整，平时坚持体育锻炼的习惯。
性功能障碍是一大类的疾病，在临床上性功能障碍比较高发的是阳痿和早泄。对于阳痿早泄的治疗，目前可以通过性感集中疗法进行治疗。主流的治疗方法还是通过口服药物来治疗，口服药物同时也要接受心理治疗。