巧克力囊肿确诊良性还是恶性应该予以手术探查的，囊肿切除之后立刻在手术室里进行冷冻切片显微化验，以确定囊肿是属良性或恶性。这种囊肿可以逐渐增大，有时会在经期或经后发生破裂，但很少发生恶变。
不一定，良性或者恶性可从患者的症状和生长速度等方面进行判断良性的卵巢囊肿一般生长慢，不良反应少，恶性的囊肿会迅速的长大，有时可能会有流血，腹痛等症状存在。良性囊肿多发生在生育期妇女身上;而恶性囊肿一般发作于青春期前少女、青少年或绝经后妇女。早期即有转移病灶，并迅速出现消瘦等恶性病变表现。体征：良性者常为单侧，可活动，表面光滑，包膜完整，囊性，不伴腹水;而恶性者有时为双侧，不活动，与周围组织常有粘连，部分为实性，表面不光滑，可能穿破包膜，种植在腹腔或盆腔内，在子宫直肠陷凹处可触到固定的结节，常伴有血性腹水，如抽吸腹水检查可能查到癌细胞。禁忌：1、饮食宜清淡，饮食应富含足够的营养，纠正偏食及不正常的饮食习惯，不宜常食刺激性、海产品等。2、适宜食物：牛奶、菠菜、山药、白菜、油菜、香菇、瘦肉、鸡蛋、鲫鱼、苹果、鸭梨、大枣、花生、黑米等。3、禁忌食品：蟹、带鱼、青鱼、鹅肉、狗肉、辣椒、生葱、生蒜、桂圆、橘子、白酒等。4、避免高度紧张及精神刺激，保持乐观情绪及充足睡眠。
判断卵巢囊肿是良性肿瘤还是恶性肿瘤，主要依据以下几个方面：第一、卵巢囊肿要根据肿物的大小判断，囊性是否伴有出血、坏死，囊内容物是浆液性还是黏液性。一般恶性肿瘤会出现实性肿物，多彩状，伴有出血坏死等。第二、卵巢囊肿需要经过手术切除来进行病理检查，并根据组织细胞结构的特点来诊断，必要时应该结合免疫组织化学染色和基因检测从而进行有针对性的治疗。
囊肿需要听过手术来决定是良性还是恶性。
囊肿按字面意思上来讲是一种良性的，分为生理性和病理性两种情况，所谓囊肿就是B超下面的影像表现，就是非常清透的回声，就是一兜水，这样叫囊肿。如果是生理性的囊肿就会消失，就是随着来一次月经囊肿就消失，叫生理性的囊肿。与之相对应的就是病理性的，就是无论过几个月经周期去复查，囊肿都存在，因为囊肿只是B超的影像表现，最终确定是什么性质，需要手术之后的病理才是金指标，确定肿瘤到底是良性还是恶性。所以遇到卵巢囊肿要定期复查，如果需要手术还是要及时手术。
建议去肿瘤科做化验，根据检查结果来判断是属于什么囊肿，再进行治疗。日常生活中应该多吃有营养的东西，积极配合检查治疗。
这种疾病是属于妇科的良性肿瘤，如果只是较小的囊肿，多喝水多观察，没有出现变化增多，没有出现疼痛以及功能性的障碍，不需要特殊治疗的，如果生长较迅速，就要进行手术治疗了。
囊肿没有良性恶性的区别，一般的囊肿都是良性的，囊肿本身不是肿瘤。宫颈囊肿是慢性炎症刺激所致，属于一种慢性宫颈炎，往往会出现阴道分泌物增多，阴道分泌物的刺激可引起外阴瘙痒，有的可出现性生活后出血等。宫颈囊肿的治疗，主要需要进行手术等治疗的。
