甲状腺功能正常的桥本甲状腺炎患者适当限碘，日常饮食可食用加碘食盐，但需适当限制海带、紫菜、海苔等富碘食物的摄入。
由于个体的差异较大，如疾病发展程度、药物敏感性、依从性、身体素质等。需要医生根据患者的具体情况选择药物。临床甲减（TSH升高且甲状腺激素水平降低）患者，给予左甲状腺素替代治疗，以维持甲状腺功能正常。如果甲状腺肿大特别明显，压迫气管、食道造成呼吸困难、吞咽困难等症状，或者伴有甲状腺恶性病变时，需要进行手术治疗。
一般情况下，桥本甲状腺炎可采取使用药物、手术治疗等方法治疗桥本甲状腺炎，具体内容如下：
当桥本氏甲亢病人的甲状腺机能不正常时，必须进行手术。不过对于桥本甲状腺没有造成甲状腺机能不正常的情况，通常会采取药物疗法，而不会采取外科和放射疗法。桥本氏甲亢，主要是由于甲亢的破坏性抗体升高，造成了甲状腺的损伤，从而造成了甲状腺机能下降。但如果做了外科和辐射，就会对甲状腺的损伤，从而导致甲亢的病情恶化。
一般情况下，桥本甲状腺炎和甲亢哪个严重的说法不正确，两者的疾病同时存在，具体内容如下：
桥本甲亢属于自身免疫型甲状腺炎，检查结果为弥漫性甲状腺肿块，质地坚硬。TPO、TGAB均为桥本甲状腺炎的确诊标准。如果结果是正常的，可以不治疗，一般半年到一年的常规体检。桥本甲状腺炎与甲亢是同时存在的，其临床上有甲亢与甲减交替的特点。甲亢是指甲状腺腺体自身机能亢进，合成分泌的甲状腺激素会增加。甲状腺机能亢进可导致肝脏机能紊乱、心血管系统紊乱、突眼性眼病。少部分患者会出现下肢粘液水肿。
实际上，桥本甲状腺炎与甲减并不是同一类疾病。甲减是指甲状腺功能减退、甲状腺分泌激素不足等原因引起的一系列内分泌临床综合征。桥本甲状腺炎属于甲状腺炎的一种，这种疾病会导致甲状腺功能减退，从而出现上述症状。患者可以按照医嘱使用左甲状腺素钠片进行治疗。当病情严重时，患者还可以通过甲状腺次全切除术甲状腺全切除术、甲状腺全切除术等方式进行治疗。
桥本甲状腺炎可以在一个月之后检查甲状腺功能及甲状腺彩超。根据血的结果看是否应用抗甲状腺药物治疗。如果甲状腺功能正常，可以暂时不要用药，不要吃海鲜，如果甲状腺功能异常应该予以相应的治疗，保持甲状腺功能正常就可以了。
桥本甲状腺炎的患者可以酌情的用艾灸，但是艾灸并不能治疗，乔本甲状腺炎，只能起到辅助治疗的作用。
因为艾灸可能在一定程度上可以缓解患者的一个临床症状，改善患者的病情，然后在一定程度上，也可以提高患者的免疫力。但是艾灸它的循证医学依据不充分，临床疗效也不确切，所以可能应用在不同的个体身上，它的疗效并不确切。所以桥本甲状腺炎，使用艾灸好与不好，可能要具体看是使用在什么个体身上，或许有一些患者使用艾灸，它的临床疗效比较明显，而有一些患者使用艾灸治疗的话，它的临床疗效不明显。