主要是方法是手术治疗。治疗目的是为了恢复上唇正常形态和正常的语言功能。目前国内外公认唇裂手术时间为生后3个月。腭裂为生后18个月。本病有一定的遗传性，预防的关键在怀孕的前三个月应该避免服用镇静类和抗癫痫类药物。
新生儿先天性上腭裂需要手术治疗。
新生儿发生先天性上颚裂时，一定要到正规的医院接受治疗，对于裂隙较窄的新生儿需要在一岁以内完成手术。对于裂隙比较严重的新生儿，可以延迟手术时间。引起先天性上颚裂的原因比较多，可能是因为遗传因素引起，也有可能是因为怀孕的时候孕妇营养不足导致，还有可能是因为怀孕的时候孕妇的内分泌紊乱造成。
家长要保证患儿的营养和正常发育，避免呼吸道感染，以使患儿在全身健康状态下接受手术。若新生儿的裂隙很宽，或双侧唇裂者前颌高耸，家长需要尽早与医院联系，医生可根据情况给予必要的指导，或提前采取一定的措施以利于手术的进行。
对于唇腭裂的原因来讲，引起发育和综合障碍的确切原因或发病机理现在尚未完全明了。大概通过实验和流行病学的观察以及调查结果，可分为多种因素影响的，而非单一因素所致。一般包括遗传因素和环境因素两个方面，并与营养、遗传、环境、内分泌等因素有关。
腭裂侧腭突的症状是先天性腭部部分或完全裂开。语音不清，伴程度不等的鼻音。唇腭裂本身来说就是一种先天发育方面的问题，和胎儿在母体内的状况有关，比如母体，如果是平时生活习惯不好，在怀孕的时候有一些不良习惯，那么孩子发育不完善的情况下比较多见。