扁桃体结石臭是因为扁桃体慢性、长期发炎导致扁桃体隐窝长期处于阻塞状态，分泌物引流不畅导致上瘾窝里存在上皮细胞脱落、白细胞、淋巴细胞、分泌物、食物残渣混在一起以及不易溶解的钙、镁等无机盐的沉积形成结石。
在扁桃体隐窝处，会有食物的残渣残留积聚，长时间的不清理，就容易导致细菌感染，细菌的繁殖。久而久之就会形成不容易溶解的钙，镁等无机盐沉积在扁桃体隐窝中，慢慢就形成结石。
扁桃体结石，如果其只是微小的食物残渣慢慢堆积而成，其可以在饭前饭后以漱口为主，都可以清出来。如果清不出，可以考虑用剜匙或者镊子将比较大的扁桃体结石去除。
扁桃体结石多发生于扁桃体上隐窝中，因为此处长期阻塞、分泌物引流不畅而成干酪样物积聚，加上不易溶解的钙、镁等无机盐沉积而成结石，其核心可为小异物、脱落的上皮细胞或细菌等。
扁桃体结石是一种细菌感染的疾病，平时一定要保持自己的口腔卫生，坚持刷牙，并且在吃饭之后一定要漱口，将口中的一些残渣清除干净，一定要保持个人的卫生干净，一定不要刺激性食物平时不要吸烟，不要喝酒，不要上火，饮食以清淡为主。
扁桃体结石并不是每个人都会出现的，多见于不注意口腔卫生的人群，扁桃体结石在于预防，要养成饭后漱口的习惯，早晚要刷牙，而且多喝水等措施都可以减少扁桃体结石的形成。因为扁桃体结石是食物残渣残留在扁桃体隐窝形成的，一般都是比较顽固的，很难去除，只能在纤维喉镜直观下进行清理。如果因为扁桃体结石导致扁桃体发炎，而且反复发作，就要考虑手术切除扁桃体。
