直肠炎可以用肛门，药剂治疗。真菌性食管炎是由白念珠菌感染引起的。严格控制抗生素的适应症。可以用抗真菌药物来进行治疗。可以进行碳13呼吸试验来确定是否存在幽门螺杆菌感染。
霉菌性食道炎可通过使用药物进行治疗。霉菌性食管炎主要是由白色念珠菌入侵食管黏膜，而形成的一种溃疡性伪膜性感染所致。主要是给予抗真菌治疗，胃镜发现的时候可以喷洒药物，起到杀菌的作用，而且副作用也比较小。平时不要滥用抗生素和激素药物，治疗使用中药常见有锡类散、云南白药、大蒜素等，西药常见有制霉菌素、二性霉素B、酮康唑、氟康唑、伊曲康唑等，对抗霉菌治疗均有效。
霉菌性食道炎吃抗生素、二性霉素B等药。
霉菌性食管炎可以口服抗生素、二性霉素B、伊曲康唑、锡类散、酮康唑等，还可以口服益生菌、嗜酸乳杆菌等调理肠胃菌群。吃药需要在医生的指导下进行用药，以免病情恶化，出现不良反应，对身体健康造成一定威胁。
日常生活中，应当注意饮食方面可以多吃新鲜的蔬菜、水果，帮助适当补充维生素C、维生素E。
经检查，霉菌性食管炎应得到良好治疗，正是霉菌感染引起的食管炎症的表达可以通过活性抗霉菌药物得到有效改善。然而，应注意饮食中少吃腌制食品，以免加重霉菌感染。同时，可以用药物来保护胃粘膜，效果会更好。
霉菌性食管炎浅表性胃炎，一般不是很严重，都是因为饮食不当出现的症状，通过系统的治疗大部分人都可以痊愈的，西医主要是给一些，消化道的抗菌素和制酸的药物，保护胃肠道黏膜的药物去治疗的，中医的治疗主要是中医的辨证分型，给一些，温中散寒和胃降逆的药物去治疗。
一般情况下，白带常规化验检查发现有霉菌，即使没有相应的症状，也建议给予药物进行治疗。具体分析如下：
通常来讲，白带有霉菌常用药物为制霉菌素栓、达克宁软胶囊或者克霉唑栓塞到阴道当中给予治疗，一般连续用药1个星期，停药之后3-7天可以去医院复查白带。如果已经转为阴性，而后再做2次白带常规化验，都是阴性就可以停止用药进行治疗。需注意的是，药物都需在专业医师建议下，遵医嘱使用。此外，当阴道内有大量念珠菌繁殖的时候，会导致白带出现豆腐渣样改变，并且会出现严重的外阴瘙痒，建议患者药积极治疗，用药期间禁止有性生活。
