引起肝硬化的病因有很多，可分为病毒性肝炎肝硬化、酒精性肝硬化、代谢性肝硬化、胆汁淤积性肝硬化、肝静脉回流受阻性肝硬化、自身免疫性肝硬化、毒物和药物性肝硬化、营养不良性肝硬化、隐源性肝硬化等。
肝硬化由于酒精引起的，长期大量饮酒导致肝细胞损害，脂肪沉积及肝脏纤维化，逐渐发展为肝硬化。还会是胆汁淤积，任何原因引起肝内、外胆管梗阻，持续性胆汁淤积都可发展为胆汁性肝硬化。
血吸虫引起肝硬化考虑与感染相关，需要积极进行治疗。
血吸虫是以瘟水、家畜等为媒介，进行皮肤传播，通常在门脉附近繁殖，可能会发生肝硬化。血吸虫病的治疗分为两个方面，一是治疗血吸虫病，二是治疗肝硬化。治疗血吸虫病主要是通过驱虫药进行驱虫，一旦出现肝硬化，就需要立即进行治疗，避免危及生命。预防血吸虫性肝硬化的主要措施是保持良好的个人卫生，不能在野外游泳，不能在洪水期间与病原体接触。治疗期间，要保持良好心态，定时检测肝功能，以明确病情发展。
肝硬化病人抵抗力低下，肝脏枯否氏细胞功能减退，加之肠道瘀血，细菌易透过肠壁进入腹腔，或进入门脉、经侧支直接进入体循环，故常并发感染如肺炎、胆道感染、革兰氏阴性杆菌败血症和原发性腹膜炎等。
大概百分之九十以上的门脉高压是肝硬化导致的，血吸虫（肝病）、酒精（肝）、乙肝、丙肝等疾病都可导致肝硬化，以乙肝为代表，乙肝病毒破坏了肝细胞后，肝脏的一些纤维组织分割了正常的结构，在此基础上产生了新的肝细胞，新的肝细胞包裹之后成为了假小叶，它会破坏肝血窦，导致门脉高压的血经过肝血窦回流至肝静脉的路径被破坏，血流不畅造成了门静脉压力的增高。