男性性功能障碍包括勃起问题、射精等，需要选用不同检查方法进行检查。
例如，以某种量表的形式请患者填写，对其某些心理问题或者对其性生活某些情况有了初步认识，除其他外，也有经过实验室考察，实验室要经过几次血液检查，例如性激素，甲状腺功能，血脂等、血糖和其他这些都会影响勃起功能。当然也可以检测前列腺液和精液中精子数等。另外就是进行了前列腺液化验后再去看，一般都能查出阳性结果。
也有一些是通过对阴茎血流动力学进行检查，例如向阴茎内注入一些血管扩张剂药物以进行b超检查，对阴性血管血流状况进行调查。
性功能障碍需做龟头神经敏感度检查、抽血化验激素水平、阴茎血流多普勒检查等检查，具体分析如下：
如果体内雄激素水平不够，可以服用十一酸睾酮胶囊或者金匮肾气丸、五子衍宗丸等补肾益气的药物。阴茎海绵体充血功能不全，可以服用枸橼酸西地那非片、红景天胶囊等。如果是因为龟头过于敏感，可以用利多卡因或达克罗宁软膏来缓解龟头的敏感度，通需要进行头神经敏感度检查、抽血化验激素水平、阴茎血流多普勒检查等检查后再选择药物治疗。
性功能障碍，比如勃起功能障碍、阳痿，常见的检查就是抽血查性激素和阴茎血流检查，或者阴茎海绵体的彩超检查、阴茎动脉造影检查。如果是早泄，B超检查前列腺精囊，或者按摩前列腺液检查；有些可能也查一下内分泌激素，比如甲状腺激素测定。
性功能障碍抽血都检查有前列腺的相关检查，包括前期液常规和前列腺的B超检查排除前列腺炎。需要抽血化验血清性激素水平，排除是由于性激素水平下降引起的。还要检查阴茎的血流多普勒和龟头神经敏感性检查。
生化检查，血、尿常规、肝功能、肾功能、血糖、血脂等常规检查，根据特殊情况，可以做性激素检查、精液常规、宫颈液常规检查。影像学检查，要是针对生殖器官的超声、CT或者是MR检查。特殊检查，根据病因进行针对性检查。
男性发生性功能障碍的检查项目，仍以患者性功能障碍的具体原因为主，因部分患者可因心理等因素导致性功能障碍，经常会有心理上的建议，从心理上加以评价。
若由某些疾病所致，应以上述原发疾病为对象，例如，患有前列腺炎这些病检查可做前列腺液常规检测。如果发生某些器质性病变时，例如，睾丸或某些激素分泌不正常，可做激素和睾丸彩超。
因此，男性性功能障碍的检查项目，仍应针对具体原因进行有针对性地检查。