甲状腺囊肿一般不严重，但囊肿极有可能产生一定的压迫症状。
甲状腺囊肿是甲状腺最常见的良性疾病之一，一般无临床症状，无需特殊处理，应保持舒适，避免紧张焦虑，定期观察。如甲状腺功能减退，需口服激素药，定期复查甲状腺功能，调整用药剂量。甲状腺囊肿直径超过3cm、短时间快速增大引起疼痛、压迫气管神经引起呼吸困难、不排除声音嘶哑和甲状腺癌的情况下，应考虑手术处理，手术在全麻下进行。根据术中快速病理结果确定最终手术方式，良性病变需考虑局部切除，甲状腺癌需考虑甲状腺癌根治术和区域淋巴结清扫。
3-4mm的甲状腺囊肿一般不算严重。
甲状腺囊肿是囊腔中有细胞凋亡后残余的细胞液，没有任何征兆，囊腔发育迟缓。当囊腔直径超过1.5cm时，会有刺痛，压迫周围的组织，需要进行合理的治疗，如药物治疗、手术治疗、物理治疗等。
另外，如果检查时发现囊肿钙化，有可能是囊肿恶变，建议尽快手术，以免疾病进一步发展或引起其他并发症。
甲状腺囊肿与甲状腺结节孰重孰轻，就是不做某种评判。
如果经常在早晨起床后感到腰酸背痛的话，那一定要到医院做检查，看一下有没有钙元素不足或其他原因导致骨质疏松，这样才会对症下药，对症治疗。一般甲状腺结节中，有不少属于良性，因此，无论是良性结节还是囊肿，其实对人体并没有太大的影响，因此，病人不必再忧虑。当然，若病人结节恶性，则是甲状腺结节比较严重，并需马上手术。因为甲状腺肿瘤一旦确诊就必须马上施行外科手术治疗。
早期甲状腺囊肿不是很重，更重要的是致病因对身体的影响还比较小，容易查找和清除。甲状腺囊肿是指在甲状腺中发现含有液体的囊状物。肿块呈圆形，直径多在2～5厘米之间，光滑，一般不疼或轻微疼痛，随着吞咽上下移动。多数是单发结节，少见于多发结节。初期是治疗甲状腺囊肿的好时期，采用科学方法治疗甲状腺囊肿是可以及时治疗的。
甲状腺囊肿是可以治好的。老年甲状腺囊肿患者早期无任何不适，多无意识发现颈前肿物，亦有甲状腺结节病史。多为单发结节，偶见多发性结节，直径多在2-5厘米之间。甲状腺囊肿块呈圆形，表面光滑边界清晰，多不痛或轻微疼痛，无触痛，可随吞咽上下移动。甲状腺囊肿囊内压不高时质软，可触及囊性感；例如，在囊肉液体多、压力高的情况下，也可以触摸强韧。
甲状腺囊肿多为良性。甲状腺癌合并囊肿少见，约1%~2%，癌性囊肿、囊液细胞学检查通常可见癌细胞。曾用手术治疗甲状腺囊肿，多切除囊肿。
手术操作造成的骨肿瘤疤痕，影响美观，有一定的并发症。目前多主张穿刺抽取和注射硬化剂治疗。这些固化剂能使囊壁发生无菌性坏死，阻止囊肿生成，使囊壁粘连，达到治疗纤维化、囊肿堵塞、囊肿的目的。该治疗对薄壁囊肿效果最好，有效率达94%。厚壁囊肿疗效差。厚壁囊肿实变肿块与周围组织无明显边界，囊肿内容物血性，反复抽吸后快速积聚，应警惕癌变可能，宜采用手术治疗。术中病理活检为恶性肿瘤，按甲状腺癌处理。