脑干出血一旦发生后，需要立即就医，并入住神经外科重症监护室。如果脑干出血量比较小，可以予以保守治疗。保守治疗主要包括动态监测患者生命体征、积极控制血压、动态复查头部CT，同时使用脱水降颅压药物、护胃药物及预防下肢深静脉血栓的药物等。
高血压脑干出血是高血压急危重状态之一，其致残和致死率极高，由于该处属生命中枢而无法进行手术和介入治疗，因此仅能保守治疗，并仅能对症处理，保持生命体征、呼吸支持、预防并发症等，尚无专门疗法，推荐就近三甲医院进行诊治。
患者可选择血管紧张素转换酶抑制剂进行治疗，对动脉粥样硬化有较好疗效，但需长期服用才能见效。也可使用血管扩张剂（，可以降低血压，改善微循环，减少血栓形成和栓塞风险。
脑干出血昏迷是一种比较常见的临床症状，首先要做头部ct检查，确定脑干出血的位置和出血量，如果出现脑干出血出了脑室，必须立即进行手术，避免出现脑脊液循环堵塞，出现急性脑积水。
所以，在这种情况下，病人必须立即进行脑室外引流术。还要检查呼吸情况，脑干出血会影响呼吸的功能和呼吸节律，如果呼吸节律缓慢，或者是表浅，需要立即进行气管插管，同时使用呼吸机进行呼吸，保证基本的氧气供应。
脑干出血的病人也可以配合高压氧治疗，有助于恢复。要多补充蛋白质，比如可以煮鱼肉，猪肉，牛肉，羊肉，虾这些含有高蛋白丰富的食物给他吃，也可以给他喝牛奶。比如核桃，杏仁，花生米这些磨成粉，用水兑成糊状给他吃。
脑溢血脑干出血是很严重的。肺部感染是脑干出血的主要并发症之一，也是导致死亡的主要原因之一。上消化道出血是脑血管疾病的严重并发症之一，即应激性溃疡，混合型上消化道出血和内侧囊内出血的脑干出血分别占49%和36%。潜在的机制是下丘脑和脑干病变。
脑干的功能非常重要，被称之为人类的生命中枢，以往高血压脑干出血常采用药物进行保守治疗，偶尔进行脑室外引流等外围手术来降低颅内压，延长病人生命。现在随着医学技术发展，外科技术进步，微创血肿显微清除技术和立体定向的血肿引流术被逐渐引入到临床中，并取得了较好效果。但该类手术的疗效还不是十分确切，还需要进行进一步的临床研究。
