巧克力囊肿生长到一定阶段，就会引起输卵管粘连、堵塞，破坏输卵管的正常生理功能，从而导致继发不孕症。多由炎症刺激引起。如果囊肿比较小，不需要手术治疗，可以密切观察，如果生长速度比较快，就要考虑手术治疗。可以选择去正规专业的医院进行检查和治疗。
妇科检查，除双合诊外，必需进行三合诊检查。腹腔镜检查是目前临床上诊断卵巢巧克力囊肿效果最好的方法，主要是在腹腔镜的辅助下对盆腔进行窥视，能够精确的找到子宫内膜异位的位置及其病因，并且对其精确诊断。
B超发现卵巢囊肿，明确告知囊肿是良性还是恶性，是否诊断卵巢巧克力囊肿，这是不现实的。b超可判定盆腔是否有囊肿，囊肿位置及囊肿内部结构，但不能诊断子宫内膜异位症。子宫内膜异位症有时很难与卵巢恶性肿瘤、结核病和炎性肿块区分开来。
B超发现卵巢囊肿，一定要医生当时明确告知囊肿是良性还是恶性，是否诊断卵巢巧克力囊肿，这是不现实的，b超可判定盆腔是否有囊肿，囊肿位置及囊肿内部结构，但不能诊断子宫内膜异位症。因为子宫内膜异位症有时很难与卵巢恶性肿瘤、结核病和炎性肿块区分开来。
月经干净后，或者月经期间都可以的，主要的检查项目包括内分泌检查、B超检查等内容。巧克力囊肿如果增长速度比较快，是需要考虑手术治疗的。当囊肿伴有出血、感染和恶性转化时，表现出异质性，CT值增加。
巢巧克力囊肿是临床上非常常见的一种卵巢疾病，严重的会影响到病患的日常生活以及工作，给女性病患带来很大的危害。针对卵巢巧克力囊肿如何检查这个问题，需要做的检查有：阴道后穹隆穿刺。超声检查，进一步检查明确病因后遵医嘱对症治疗。