患有肛瘘，药物治疗的效果不是很好，尽量还是手术治疗，可以选择三级以上医院进行手术治疗，术后护理很快就会恢复，通常多喝水，多吃蔬菜水果。少吃辛辣食物，尽量保持大便通畅，防止便秘，不抽烟不喝酒，不熬夜，工作和休息规则。
肛瘘术后可以抽烟，但是尽量少抽。术后需要每天肛门中药坐浴，然后摸药膏，每天肛门消毒换药，大便后也需要清洗肛门。注意饮食，不能喝酒，不能吃辣椒，多吃水果和蔬菜，清淡饮食，保持大便通畅。便秘、腹泻会引起伤口水肿。一般术后一个月左右伤口可以完全愈合。
肛瘘不手术正常是不能恢复的。肛瘘属于肛门周围炎症感染性的疾病，很多病人是继发在肛周脓肿的基础之上的。脓肿自行破溃、自行愈合以后是假性愈合，然后会在肛门周围形成肛瘘。
多吃润肠通便的果蔬，例如苹果、香蕉、梨等、冬瓜、香蕉、黑芝麻油，蜂蜜水等。为了促进肠蠕动还可喝酸奶，多食含膳食纤维丰富的食物，例如麦麸、豆类等。忌食有刺激性的食物，如酒类，辣椒，海鲜等。
低位复杂肛瘘疾病容易复发，所以要注意坐时要让肛门处于悬空状态，便后用水清洗肛部，可以在医院买个电动肛门护理包，里面有肛部清洁器帮助便后清洗，肛部药浴盆放在马桶上熏蒸坐浴，坐姿时用肛部支撑垫帮助悬空伤口，促进水肿消退。