蛋白尿为病理性疾病，主要是肾小球基底膜通透性增加导致血浆的大量蛋白从基底膜渗透，通过尿液排出，产生低蛋白性水肿。蛋白尿常见于肾小球疾病，如急性肾小球肾炎、肾病综合征、肾病、紫癜性肾炎、狼疮性肾炎及遗传性肾炎等，肾小球基底膜通透性受到损害而出现蛋白尿。此外，还有较少病人会出现体位性蛋白尿或因剧烈运动等原因产生暂时性蛋白尿。
人体尿液里不含蛋白质或只含有微量蛋白质，但当肾脏发生病变时，随血液循环流动的蛋白质流经肾脏时，因为肾脏滤过功能的降低而使蛋白质漏网。蛋白质漏进尿液从尿道排出来形成了蛋白尿。
蛋白尿一般为病理性疾病，主要是肾小球基底膜通透性增加导致血浆的大量蛋白从基底膜渗透，通过尿液排出，产生低蛋白性水肿。蛋白尿常见于肾小球疾病，如急性肾小球肾炎、肾病综合征、IgA肾病、紫癜性肾炎、狼疮性肾炎及遗传性肾炎等，肾小球基底膜通透性受到损害而出现蛋白尿。
肾结石患者伴蛋白尿，但此类蛋白尿被认为是组织型蛋白尿，通常不会考虑为肾炎，当然，不排除肾结石并发肾炎的可能性。
根据患者肾结石病史前有无尿检异常，若结石前已有肾炎病史，认为结石为肾炎恶化之诱因，而非尿蛋白发生的诱因，又称结石伴肾炎。其次就是根据病人是否伴有肾功能损害，或者肾脏功能不全，判断是否存在肾实质性病变，因为肾结石会导致肾小球滤过率下降，从而造成蛋白尿。再就是视处理情况而定，若结石患者，经积极治疗后结石已完全减轻，然后结石导致蛋白尿要少了。
因此，若结石排除后仍出现蛋白尿，则认为是结石并发肾炎。其次，对于肾功能不全的患者来说，在肾脏受损之前会存在着一定程度的蛋白尿。若结石排除后，蛋白尿的转移被考虑在内，系结石所致蛋白尿。
尿蛋白可以是一个一过性的尿蛋白，运动过量或者天热机体的体温升高，都可能出现，而那种持续性的尿蛋白多数是一个病理状态，可能是慢性肾小球肾炎、肾炎综合征或者其他的一些肾脏损害导致。