如果蛋白尿不治疗，根据不同的病因有不同的预后。
长期存在蛋白尿，会逐渐出现肾损害，肾功能衰竭的可能。容易导致营养不良，感染，另外，蛋白尿引起小管间质缺氧加重，蛋白尿重消化各消化大量蛋白需要额外的能量，可造成小管细胞缺氧，以致引起小管细胞的损伤。
如果确诊为蛋白尿，就要及时进行正规的治疗，建议低盐、低脂、优质蛋白质饮食，避免剧烈运动。
当出现蛋白尿时，首先应注意平时的饮食，应该吃优质低蛋白饮食，避免高蛋白食物的摄入。如果有高血压或者糖尿病病史，需要严格控制血压及血糖，使其达到标准水平，可联合应用一些降低尿蛋白、保护残余肾功能的药物，如果是不明原因的蛋白尿，需要查明其原因，通常需要完善肾穿刺活检以明确病理分型有利于进一步指导治疗。
如果蛋白尿不治疗，根据不同的病因有不同的预后。在肾炎的患者中，如果蛋白尿不进行治疗的话，长期存在蛋白尿，会逐渐出现肾损害，肾功能衰竭的可能。
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蛋白尿是一种症状，它的发生提示是属于肾脏的问题，大部分是肾脏的炎症感染引起，需要及早的进行检查、治疗，去做尿蛋白定量进行测定，如果量多是需要进行肾脏的穿刺检查了解病因，配合有效的药物进行治疗，好好的休息定期复查。
需要长期治疗，早期使用药物治疗，严重时需要激素联合细胞毒类药物治疗。蛋白尿多见于急性肾炎、慢性肾炎等情况，如果是急性肾炎所引起的蛋白尿，是可以自愈的，因此是可以治好的。如果是慢性肾炎，包括各种继发性肾病等，所引起的蛋白尿，则可以控制症状，缓解病情，很难治愈。
尿蛋白阳性的治疗，需要明确是肾小球还是肾小管疾病。如果24小时尿蛋白定量超过一克，考虑肾小球疾病，需要针对病因进行治疗，比如糖尿病肾病需要用使用降糖药或胰岛素控制血糖，如果是原发性的肾小球肾炎，可能需要使用激素或者是激素联合免疫抑制剂。