新生儿呼吸困难的原因，应该及早到医院进行检查，查明病因以后再针对性治疗。如果新生儿出现呼吸困难，可能是由于呼吸系统本身的原因、肺外的原因。例如，新生儿重症肺炎、新生儿呼吸窘迫综合征、新生儿肺不张、新生儿肺气肿、新生儿气胸、新生儿肺发育畸形等均可引起呼吸困难。有先天性心脏畸形，也会导致呼吸困难。腹部和胃内容物的增加导致横膈膜上升，对肺部的压迫也会导致呼吸困难。
新生儿先天性心脏病筛查的方法，主要通过医生的临床查体和心脏的超声检查来进行，医生通过心脏的叩诊和心脏各瓣膜区的听诊，来判断新生儿是否有心脏的异常，如果发现有病理性的杂音，再进一步进行心脏超声的检查。
一般情况下，新生儿心脏不好的病因有很多，最主要的是先天性心脏病。先天性心脏病是指在胚胎时期发生的某些组织上的畸形。表现为喂养困难：正常人一次哺乳10-15分钟，但先天性心脏病患儿会出现进食中断现象；
还会出现发紫性紫癜：有的先天性心脏病，从一开始就发青，有的孩子在哭泣或挣扎的时候，会出现口周、四肢末端发绀；并且发育不良。
新生儿呼吸困难症可以通过氧气机来进行呼吸，这段时间一定保护好孩子的个人卫生，保持空气的流畅，促进呼吸，清除气道内的分泌物，让孩子保持一个良好的睡眠质量，严重需要建立一个人工的气场，增强呼吸。
新生儿黄疸可能会全身黄。
新生儿黄疸也称新生儿高胆红素血症，这是因为人体内胆红素积累导致的皮肤，黏膜等器官出现黄染，这是新生儿最常见的症状，也就是生理性黄疸和病理性黄疸。
首先，家长可以用肉眼观察孩子的脸部和眼睛，看是否有发黄的迹象，并注意到孩子的排泄物和排泄物颜色有无变化。有可能是因为新生儿出现了黄疸。
新生儿心脏间隔缺损原因如下：
胎儿的心脏间隙缺损其实是胎儿期就有的，在产前就可以被检查出来，主要是房间隔或室间隔的缺损。一般来说，卵圆孔的未闭就是房间隔的缺损，在子宫内是存在的，但是在胎儿出生后，由于呼吸的变化，会自动闭合，这种情况也会有不同的临床表现和症状，要根据具体的情况进行处理，如果是室间隔缺损，那么以后就有可能要进行手术。