早晨口臭可能与口腔和胃肠道疾病、鼻咽部的疾病、呼吸道疾病等都有可能有关联。吸烟、饮酒、喝咖啡，以及经常的吃葱、蒜、韭菜等辛辣刺激的食物，或者是嗜好臭豆腐等具有臭味食物的人，也容易引起口臭。此外，晚上如果吃得过饱，吃得过于油腻，或者是辛辣刺激性的调料，也会导致早晨有口臭的问题。
口腔局部疾患是主要导致口臭的原因，但不容忽视的是，口臭也常是某些严重系统性疾病的口腔表现，有一些器质性疾患也会导致口臭症。口臭的原因很多，但大多数都是由口腔问题引起的，应该进行的口腔洁治就是洗牙，平时注意口腔卫生。如果还没有明显改善应该去呼吸内科和消化内科咨询一下。
这种需要及时的去进行洗牙，彻底清除牙齿局部的牙结石以及烟渍，恢复牙周的健康，而且一定要注意良好的刷牙习惯，还需要学会应用牙线等清理牙的邻间隙，这样一般就能有效的改善口臭。也要注意戒烟，少吃肉类，多吃水果、蔬菜，吃饭后及时的刷牙，保持良好的生活习惯和口腔卫生能够明显有效的减少口臭。
平时没有口臭的人晨起也不会有口臭，若平时就有口臭，那口臭在每天早晨刚醒来时可能是最严重的。因为在睡眠时，口腔活动减少，唾液分泌减弱，细菌大量繁殖，产生大量使人不愉快的气体。
口臭多由口腔疾病引起，如牙龈炎，牙髓炎，龋齿等。萎缩性咽炎，慢性扁桃体炎，胃肠道疾病及便秘也可引起口臭。可以去医院就诊，如有这些疾病要及早去除，同时还要注意保持口腔卫生。仔细刷牙，勤用漱口水漱口，定期洗牙去除牙石。戒烟酒，忌辛辣厚味饮食，多吃蔬菜水果。也可去中医科就诊。