巧克力囊肿会出现性交痛，这是最明显的症状，而且常于月经前较为明显，也有少数女性会因巧克力囊肿而引发白带增多、色黄或是有异味，也可能回出现白带夹有血丝等症状，可能去正规的医院检查一下。
早期巧克力囊肿主要症状有性交疼痛，白带增多、色黄或是有异味有的时候也可出现白带夹有血丝的情况，其次有痛经的情况，80%的早期巧克力囊肿会有痛经的表现，医院妇科检查明确。
巧克力囊肿的表现是进行性加重的痛经，可以在经前、经期、或经后出现，月经紊乱，由于巧克力囊肿对于卵巢有破坏作用，造成卵巢不排卵，分泌雌激素的水平也下降，从而导致月经紊乱，不孕不育，腹痛，主要与囊肿破裂后出现。
做，巧克力囊肿的初步诊断，主要是根据B超检查结果来判断。要结合临床病史综合性的分析，这种病人常常伴有痛经的情况，并且呈持续性加重的状态。巧克力囊肿大约有40%-50%的病人，在临床上会有不孕不育的病史。所以，除了做B超检查，还要结合病史综合性的分析。
应去专业的正规医院接受详细的检查，根据囊肿大小做进一步的治疗，囊肿大的话就需要住院治疗，治疗时间要看病人的恢复情况而定，注意调养生活的习惯，忌辛辣的食物，发性的食物应少吃比较好。
轻度巧克力囊肿又名卵巢子宫内膜异位囊肿，是子宫内膜异位症的一种病变。常见的有痛经、下腹痛、经期发热，痛经是子宫内膜异位最明显的症状，却是最容易忽略的先兆，常进行性加重，性交疼痛也是一个明显的信号，可能还伴有点状出血，卵巢巧克力囊肿的症状并不是十分的明显，还会出现不孕及月经失调等症状。