慢性细菌性痢疾的治疗原则是消除感染、提高机体的抗病能力和调整肠道的功能。急性细菌性痢疾是由治疗不及时、疗效不明显、营养不良引起的。其主要症状是腹痛，腹泻，腹胀等。在治疗方面，如果出现志贺菌，需要立即口服双歧杆菌三联活菌散，并配合口服思密达等肠粘膜保护剂，以调整肠道功能。2%的磺胺银可以保留灌肠，也可以口服中药来调理身体，提高免疫力。
慢性细菌性痢疾的症状是腹痛、里急后重、腹泻、大便中混杂有粘液脓血等。
细菌性痢疾是由痢疾杆菌感染引起的，可以选择三代头孢地尼，也可以选择喹诺酮类，但是18岁以内的儿童不能服用喹诺酮类药物，可以服用复方黄连素片或盐酸小檗碱片。如果经常出现腹泻，也要避免出现脱水的情况，可以服用一些补液盐，同时要注意饮食的清洁，并且要在饭前和饭后洗手。
一般情况下，婴儿细菌性痢疾主要是由于细菌感染导致的肠粘膜受损，因此会出现大量的腹泻，但是一次大便的数量很小，主要是粘液脓血便，呈粘稠状，呈粘稠状，呈红色，少数会导致感染性休克。感染性休克的主要症状是高烧、肢体发绀。腹泻引起的感染性休克需要立即进行抗休克。抗生素过敏的话，病情会迅速改善，主要是要清除病菌，在这种状态下要及时应用抗生素。多数肠炎患者都是不能使用抗生素的，否则会导致疾病恶化。如果孩子出现多次的拉肚子，尤其是宝宝，没有其它的征兆，只有大便的时候哭，这是很严重的一种征兆。
通常情况下，婴儿细菌性痢疾腹泻可以通过药物来治疗。具体情况分析如下：
婴儿细菌性痢疾腹泻的治疗，首先是应用抗菌素，细菌性痢疾是感染了痢疾杆菌造成的，此时就要应用头孢克肟等头孢菌素进行抗细菌治疗，等肠道的细菌被杀灭以后，孩子的腹泻症状自然就会好转。其次是给予对症支持治疗，如果腹泻的量比较多，要给予口服补液盐以纠正脱水和电解质的紊乱；发热超过腋下38.5度时，要给予布洛芬退热。
急性菌痢的患者会出现腹痛，低热，血便以及恶心呕吐等症状，起病比较急但是肠道的炎症反应比较低。而慢性菌痢的患者会出现疾病的反复发作，并且会变化为结肠溃疡性病变，溃疡的边缘会有息肉的形成，严重的患者体内肠腺会出现堵塞，形成囊肿。而中毒性菌痢的患者则可能出现中毒性休克等症状。治疗细菌性痢疾应该对患者进行胃肠道隔离以及卧床休息。
治疗的方法有局部灌肠疗法：使较高浓度的药物直接作用于病变部位，以增强杀菌作用，并且刺激肉芽组织新生，一般作保留灌肠。还有抗感染的治疗方法，选择敏感抗菌药物，静脉给药，待病情好转后改口服。