卵巢囊肿有生理性和病理性两种，生理性卵巢囊肿会随着月经来潮而萎缩，病理性的卵巢囊肿与炎症刺激、内分泌失调有关。单侧囊肿，一侧也能排卵，可以受孕。如果两侧都有囊肿，而且体积在5cm以上，就会影响到怀孕。
这是因为卵巢囊肿会影响到卵巢的正常功能，从而引起内分泌紊乱，或者是囊肿会阻碍卵泡的发育和成熟，从而影响到黄体的功能，从而影响到受孕。达到5cm是必须要做手术的，否则可能会出现撕裂和扭曲。
我们说的卵巢囊肿其实不影响女性的生育。第二如果这个卵巢的肿瘤或者卵巢肿物需要手术治疗，这个手术的适应症是存在的，在手术的过程当中，也会考虑尽量的保护卵巢的功能和生育功能，不会因为手术本身，对生育功能造成特别严重的影响。
通常情况下，卵巢囊肿手术可能会影响怀孕，也可能不会。具体分析如下：
卵巢囊肿手术是否影响生育与囊肿的大小以及手术方式有很大的关系。如果是单纯的良性囊肿，并且不大，通常不会影响患者怀孕。但是如果卵巢囊肿较大，在做手术时可能就会损伤到周围组织，如输卵管，子宫等，所以这种手术可能会影响怀孕。有时处理恶性的卵巢囊肿，可能会把同侧的附件也同时切除，那么就会导致怀孕的概率降低。
卵巢囊肿是妇科系统比较常见的良性肿瘤之一，通常不会对身体造成影响，可以不做处理，也不会影响怀孕。如果囊肿较大或者影响了生殖系统功能，就要做手术或者介入治疗。平时多注意休息，保持卫生，保持生活规律，不要吃生冷刺激性食物，注意保暖。
如果囊肿尤其是月经干净后复查在五厘米以上，建议病人先明确囊肿是良性还是恶性，在怀孕前把囊肿去除；如果是良性的囊肿，且较小，一般是不会对胎儿有影响的。可以继续妊娠；如果囊肿很小，对排卵功能没有影响，那么就不会影响怀孕。
卵巢囊肿会影响生育主要表现在会使已怀孕的女性产生妊娠不良的现象。
卵巢囊肿在早孕时可能引起流产，中期妊娠时则易发生卵巢囊肿蒂扭转，晚期妊娠囊肿较大者可导致胎位异常，分娩时可能阻塞产道引起难产。妊娠期盆腔充血，可使肿瘤迅速增大甚至有引起恶变的可能，所以，在妊娠前进行手术比妊娠手术更有好处。如果已经怀孕了，那么卵巢囊肿手术在16-24周时进行最为合适。手术本身并不会影响胎儿的发育，但如果在妊娠期12周内进行手术则容易导致流产，而妊娠晚期进行手术也比较困难，同样容易引起流产。
