大多数人群感觉肠镜更为难受一些。
肠镜检查的时间较长，且检查过程前需要灌肠，检查中腹胀、腹痛的症状也相对比较明显，所以肠镜检查可能较难受一些。如果是做无痛的肠镜和胃镜，通常不是特别难受的，而且在做肠镜和胃镜检查的时候，一定要空腹检查，因为空腹检查才可以保证检查结果的准确性，而且还能避免检查过程中出现呕吐。
建议：平常应注意保护好胃肠健康，定时适量吃饭，少吃刺激性的食物，不喝酒不抽烟。
无痛胃镜肠镜有危险，具体分析如下：
首先，就是麻醉的风险，虽然是速效麻醉剂，但如果用药不当，很可能会出现精神错乱、烦躁、缺氧缺血性脑病、植物状态、死亡等。另外，与普通胃肠镜相比，因为缺乏沟通，所以在手术中，肠镜会出现充气过多、进镜速度过快，从而增加肠穿孔和系膜的过度牵扯。这就要求有熟练的麻醉师和内窥镜医生配合，才能进行无痛胃肠镜检查。
做肠镜检查时管子是从病人的肛门部位伸进去的，在伸入时，出了羞耻以外，病人还会产生明显的便意，会想排便，肚子胀得难受。在管子进入拐弯的点时，还会感觉到肚子痛。做胃镜检查时管子是从病人的嘴里插入的，病人会觉得恶心，想吐，窒息，喘不上气。在做胃镜检查的过程中，病人常常忍不住的流泪，流鼻涕，流口水。
一般来说，胃镜要稍微比肠镜痛苦一点，具体分析如下：
肠镜和胃镜检查在临床上很普遍，并且随着医疗手段的改进，这两项检查基本都不会非常难受，通常胃镜要稍微比肠镜痛苦一点。建议患者前往正规医院进行胃镜和肠镜，以免导致检查结果出现偏差。如果患者出现不适症状，建议患者根据实际情况前往医院就诊检查，然后在医生的指导下进行治疗。
一般来说，以下人群应该做胃镜肠镜。具体分析如下：
胃镜、肠镜可同时进行，特别是无痛胃肠镜检查，所以对于中年人应该及时进行检查，如此才能做到早发现早治疗。其次对于本身患有胃肠道疾病的患者，也需要做胃镜肠镜来确诊疾病。
建议可能出现胃部疾病的患者及时到医院进行检查，明确病因后进行针对性治疗，避免因治疗不及时，所导致病情加重。
肠镜、胃镜的价格与检查的病情和设备不同，费用在300元-500元左右。
一般普通胃肠镜检查需要260-300元左右，无痛胃肠镜检查则要800-1000元左右，加上麻醉，费用在1000元-2000元左右。肠镜大概也在400元左右。当然这是检查费用，如果出现切除息肉或者做病理的话，是单独收费的。一般二甲医院普通胃镜和普通结肠镜分别是280元左右，无痛胃镜和无痛结肠镜是600元左右；三甲医院普通胃肠镜是400元左右，无痛胃肠镜是1000元左右。