肥厚梗阻型心肌病的处理方法有心脏超声检查、不要做增加心脏负荷的剧烈活动、心脏切除手术等。
就诊时最好是让亲属做一次心脏超声检查，看看是否有遗传性。在处理方面，不要做任何会增加心脏负荷的剧烈活动，比如用力大小便、快跑等；其次是药物治疗，可以口服地尔硫卓和美托洛尔减缓疾病的发展；如果有必要的话，还可以进行心脏切除手术。
肥厚性心肌病根据左心室出道可否阻塞而划分为非阻塞型和阻塞型。呼吸困难是肥厚梗阻型心肌病的常见症状。
其症状是在运动之后出现的，以劳力性的呼吸困难为主。其次是胸部疼痛，这种疼痛可以发生在平静的环境中，也可以发生在疲劳状态。在心肌病中，有20%左右会发生晕厥，有些人只会有眩晕、黑蒙等症状，而肥大梗阻性心肌病则以突发猝死最为突出。
肥大型心肌病是一种以心室肌不对称肥大为特点的心肌病，其表现为室间隔明显增厚，使心室腔狭窄，体积减小，室壁增厚，有效的心输出能力降低，并伴有多种心律不齐，甚至会导致猝死。
肥厚型心肌病根据有无阻塞性肥厚型心肌病和梗阻性肥厚型心肌病。非阻塞性肥厚性心肌病，流出道无阻塞，可用ACEI或ARB类的药物进行治疗，同时伴有恶性心律失常的患者可以选择ICD。
肥厚型心肌病梗阻一般指肥厚型梗阻性心肌病。而肥厚型梗阻性心肌病患者感冒可以通过一般治疗、使用药物等方法进行治疗。
肥厚型梗阻性心肌病特征为心室肌肥厚，典型者在左心室，以室间隔为甚，偶尔可呈同心性肥厚。左心室腔容积正常或减小。偶尔病变发生于右心室。如果肥厚型梗阻性心肌病患者感冒了，但症状比较轻微，可以多喝温水，有助于缓解症状；但如果症状较重，建议在医生的指导下使用药物进行治疗，常用的药物主要有感冒清片、感冒灵颗粒等。
肥厚性梗阻型心肌病是心脏功能性障碍病变之一，在许多情况下，又称主动脉瓣下梗阻，主要原因为心室间隔高度肥厚程度约为左心室游离壁厚度3倍以上，疾病多见于中老年人，普通青少年患这种病，主要是由于家庭中存在着遗传因素，对于这种心肌病，心机厚度需通过心电图检查及超声心动图检查才能了解。
通常诊断为肥厚型梗阻型心肌病时，心肌厚度都有一定的规定，常规下为心肌厚度都在20毫米以上，而检查时，心室间隔高度肥大已超过左心室3倍厚。正常心肌壁厚度及心室间隔约为8-12mm，超出此范围均可称之为心肌肥厚，但肥厚型梗阻型心肌病不能仅凭心肌壁的厚度诊断。
扩张型心肌病与肥厚型心肌病的区别有发病原因不同、治疗方式不同等。
扩张性心肌病的发病原因主要是心肌的增大；而肥大性心肌疾病是由心肌细胞增粗和错位引起的。两者均可以根据心电图、心脏彩超等检查的表现初步诊断，而心肌组织切片是诊断手段。但是，治疗方式不同，肥厚型心肌病患者可以通过外科和化疗来进行治疗，而扩张性心肌疾病则需要进行心脏替换。