肝癌介入治疗的副作用有：局部疼痛。肝癌被栓塞后血液循环会中断，肿瘤在缺血缺氧的情况下产生乳酸，病人出现局部疼痛。发烧：随着肿瘤缺血缺氧坏死，坏死的物质在被机体吸收过程中，部分肿瘤介质会进入体温调节中枢，使体温上升。
肝癌介入的副作用主要是放射线对人体的影响，会出现掉发乏力，头晕恶心，身体消瘦的症状，肝癌介入和放射治疗都是一个比较好的保守治疗的方式，而且对于癌细胞也有一定的抑制和控制作用。但是从长远角度讲，还不能够彻底的消灭肿瘤，只是在一定程度上延长生存期，和提高生活质量。
肝癌介入治疗的副作用，有以下几个方面，首先像肝动脉导管栓塞化疗，它本身是一种化疗，就同时具有所有化疗的一些副作用，比如恶心呕吐、脱发、乏力、免疫力下降，这些可以通过一些中医的调理，或者是增强免疫力的药物来改善，另外射频消融该方法，它本身直接的将肿瘤细胞，通过热烧的方法烧死，这样，就会有一些局部的疼痛感，再一个就是有时候一些肝癌晚期的病人，会合并有黄疸，全身皮肤黏膜的黄染、腹水，然后身体的抵抗力比较下降，这两种介入方法治疗，会加重病人这方面的症状。
介入治疗的副作用相对较小，所以请不要担心副作用大。如果确诊，应该要接受治疗，以防止疾病恶化。如果这种介入治疗不能达到比较好的治疗效果，可以采取中药辅助治疗的形式。对于处于早期或中期治疗阶段，需要手术切除。
一般术后2~3天就可以回家了。肝癌微创介入治疗过后，可能会出现腹痛肝功能损伤，所以术后一般24小时过后需要检查一下肝功能。如果术后24小时，没有明显的腹痛，肝功能基本正常就可以回去了。
射频、微波同属于热疗法治疗肿瘤，效果是一样的。由于微波针采用冷循环方式，单针形式局部同样产生球形凝固区，同射频达到相同效果，这个结论已得到医务界的认可。射频、微波治疗肝癌属于微创针式治疗，痛苦小、疗效可靠、适应证广，是治疗肝癌重要的治疗措施。